Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERVW-1Q9UQF0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVW-1Q9UQF0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms