RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537171.5

RHOF-203, Transcript of ras homolog family member F, filopodia associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RHOF, Length 1,485 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOF-203ENST00000537171 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.07■■■■■ 6.73
RHOF-203ENST00000537171 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.36■■■■■ 5.65
RHOF-203ENST00000537171 ABCC9O60706 1549 aa48.85■■■■■ 5.41
RHOF-203ENST00000537171 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.62■■■■■ 5.21
RHOF-203ENST00000537171 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
RHOF-203ENST00000537171 NACADO15069 1562 aa47.28■■■■■ 5.16
RHOF-203ENST00000537171 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.22■■■■■ 5.15
RHOF-203ENST00000537171 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.22■■■■■ 5.15
RHOF-203ENST00000537171 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.16■■■■■ 5.14
RHOF-203ENST00000537171 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.16■■■■■ 4.98
RHOF-203ENST00000537171 SCRIBQ14160 1630 aa46.02■■■■■ 4.96
RHOF-203ENST00000537171 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.85■■■■■ 4.93
RHOF-203ENST00000537171 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
RHOF-203ENST00000537171 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.39■■■■■ 4.86
RHOF-203ENST00000537171 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.58■■■■■ 4.73
RHOF-203ENST00000537171 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
RHOF-203ENST00000537171 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.47■■■■■ 4.71
RHOF-203ENST00000537171 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.21■■■■■ 4.67
RHOF-203ENST00000537171 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
RHOF-203ENST00000537171 SMARCA4P51532 1647 aa44.11■■■■■ 4.65
RHOF-203ENST00000537171 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
RHOF-203ENST00000537171 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.8■■■■■ 4.6
RHOF-203ENST00000537171 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
RHOF-203ENST00000537171 NCAPD3P42695 1498 aa43.71■■■■■ 4.59
RHOF-203ENST00000537171 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.71■■■■■ 4.59
RHOF-203ENST00000537171 SMARCA2P51531 1590 aa43.67■■■■■ 4.58
RHOF-203ENST00000537171 WIZO95785 1651 aa43.53■■■■■ 4.56
RHOF-203ENST00000537171 HMGXB3Q12766 1538 aa43.43■■■■■ 4.54
RHOF-203ENST00000537171 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
RHOF-203ENST00000537171 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
RHOF-203ENST00000537171 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
RHOF-203ENST00000537171 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.65■■■■■ 4.42
RHOF-203ENST00000537171 NESP48681 1621 aa42.48■■■■■ 4.39
RHOF-203ENST00000537171 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.46■■■■■ 4.39
RHOF-203ENST00000537171 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.36■■■■■ 4.37
RHOF-203ENST00000537171 CFTRP13569 1480 aa42.31■■■■■ 4.36
RHOF-203ENST00000537171 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.08■■■■■ 4.33
RHOF-203ENST00000537171 ERCC6Q03468 1493 aa41.96■■■■■ 4.31
RHOF-203ENST00000537171 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.91■■■■■ 4.3
RHOF-203ENST00000537171 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.91■■■■■ 4.3
RHOF-203ENST00000537171 PRDM2Q13029 1718 aa41.89■■■■■ 4.3
RHOF-203ENST00000537171 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.75■■■■■ 4.27
RHOF-203ENST00000537171 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
RHOF-203ENST00000537171 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.6■■■■■ 4.25
RHOF-203ENST00000537171 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
RHOF-203ENST00000537171 WDR62O43379 1518 aa41.45■■■■■ 4.23
RHOF-203ENST00000537171 CUX2O14529 1486 aa41.36■■■■■ 4.21
RHOF-203ENST00000537171 TOPBP1Q92547 1522 aa41.32■■■■■ 4.21
RHOF-203ENST00000537171 ABCC8Q09428 1581 aa41.31■■■■■ 4.2
RHOF-203ENST00000537171 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.26■■■■■ 4.2
RHOF-203ENST00000537171 CUX1P39880 1505 aa41.24■■■■■ 4.19
RHOF-203ENST00000537171 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.14■■■■■ 4.18
RHOF-203ENST00000537171 SYNJ1O43426 1573 aa41.01■■■■■ 4.16
RHOF-203ENST00000537171 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.01■■■■■ 4.15
RHOF-203ENST00000537171 TOP2BQ02880 1626 aa40.98■■■■■ 4.15
RHOF-203ENST00000537171 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.97■■■■■ 4.15
RHOF-203ENST00000537171 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.95■■■■■ 4.15
RHOF-203ENST00000537171 IFT140Q96RY7 1462 aa40.89■■■■■ 4.14
RHOF-203ENST00000537171 SOGA1O94964 1423 aa40.88■■■■■ 4.14
RHOF-203ENST00000537171 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.87■■■■■ 4.13
RHOF-203ENST00000537171 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
RHOF-203ENST00000537171 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
RHOF-203ENST00000537171 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.62■■■■■ 4.09
RHOF-203ENST00000537171 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
RHOF-203ENST00000537171 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
RHOF-203ENST00000537171 TRIM41Q8WV44 630 aa40.59■■■■■ 4.09
RHOF-203ENST00000537171 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.57■■■■■ 4.08
RHOF-203ENST00000537171 WDR97A6NE52 1622 aa40.56■■■■■ 4.08
RHOF-203ENST00000537171 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
RHOF-203ENST00000537171 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.38■■■■■ 4.05
RHOF-203ENST00000537171 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.37■■■■■ 4.05
RHOF-203ENST00000537171 GRIN2BQ13224 1484 aa40.27■■■■■ 4.04
RHOF-203ENST00000537171 KIF27Q86VH2 1401 aa40.23■■■■■ 4.03
RHOF-203ENST00000537171 PBRM1Q86U86 1689 aa40.17■■■■■ 4.02
RHOF-203ENST00000537171 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.17■■■■■ 4.02
RHOF-203ENST00000537171 IGF1RP08069 1367 aa40.13■■■■■ 4.02
RHOF-203ENST00000537171 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.13■■■■■ 4.02
RHOF-203ENST00000537171 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
RHOF-203ENST00000537171 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
RHOF-203ENST00000537171 SYNJ2O15056 1496 aa39.95■■■■□ 3.99
RHOF-203ENST00000537171 FBLN2P98095 1184 aa39.94■■■■□ 3.98
RHOF-203ENST00000537171 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.93■■■■□ 3.98
RHOF-203ENST00000537171 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
RHOF-203ENST00000537171 ADAMTS12P58397 1594 aa39.91■■■■□ 3.98
RHOF-203ENST00000537171 CHD1O14646 1710 aa39.87■■■■□ 3.97
RHOF-203ENST00000537171 OSCARQ8IYS5 282 aa39.87■■■■□ 3.97
RHOF-203ENST00000537171 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.84■■■■□ 3.97
RHOF-203ENST00000537171 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.8■■■■□ 3.96
RHOF-203ENST00000537171 EEA1Q15075 1411 aa39.79■■■■□ 3.96
RHOF-203ENST00000537171 CUL7Q14999 1698 aa39.78■■■■□ 3.96
RHOF-203ENST00000537171 GRIN2AQ12879 1464 aa39.77■■■■□ 3.96
RHOF-203ENST00000537171 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
RHOF-203ENST00000537171 PRXQ9BXM0 1461 aa39.67■■■■□ 3.94
RHOF-203ENST00000537171 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.62■■■■□ 3.93
RHOF-203ENST00000537171 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.61■■■■□ 3.93
RHOF-203ENST00000537171 NUP160Q12769 1436 aa39.61■■■■□ 3.93
RHOF-203ENST00000537171 CEP170Q5SW79 1584 aa39.55■■■■□ 3.92
RHOF-203ENST00000537171 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.5■■■■□ 3.91
RHOF-203ENST00000537171 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.36■■■■□ 3.89
RHOF-203ENST00000537171 KIF21BO75037 1637 aa39.33■■■■□ 3.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms