RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396782.2

LTB4R-202, Transcript of leukotriene B4 receptor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB4R, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB4R-202ENST00000396782 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.8■■■■■ 6.68
LTB4R-202ENST00000396782 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.16■■■■■ 5.62
LTB4R-202ENST00000396782 ABCC9O60706 1549 aa48.37■■■■■ 5.33
LTB4R-202ENST00000396782 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
LTB4R-202ENST00000396782 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.22■■■■■ 5.15
LTB4R-202ENST00000396782 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47■■■■■ 5.11
LTB4R-202ENST00000396782 NACADO15069 1562 aa46.96■■■■■ 5.11
LTB4R-202ENST00000396782 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.9■■■■■ 5.1
LTB4R-202ENST00000396782 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.84■■■■■ 5.09
LTB4R-202ENST00000396782 SCRIBQ14160 1630 aa45.88■■■■■ 4.94
LTB4R-202ENST00000396782 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.86■■■■■ 4.93
LTB4R-202ENST00000396782 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
LTB4R-202ENST00000396782 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.4■■■■■ 4.86
LTB4R-202ENST00000396782 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.34■■■■■ 4.853e-6■■■■□ 24.3
LTB4R-202ENST00000396782 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.19■■■■■ 4.66
LTB4R-202ENST00000396782 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
LTB4R-202ENST00000396782 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.98■■■■■ 4.63
LTB4R-202ENST00000396782 SMARCA4P51532 1647 aa43.93■■■■■ 4.62
LTB4R-202ENST00000396782 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.81■■■■■ 4.6
LTB4R-202ENST00000396782 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.79■■■■■ 4.6
LTB4R-202ENST00000396782 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.67■■■■■ 4.58
LTB4R-202ENST00000396782 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.57■■■■■ 4.57
LTB4R-202ENST00000396782 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.47■■■■■ 4.55
LTB4R-202ENST00000396782 SMARCA2P51531 1590 aa43.46■■■■■ 4.55
LTB4R-202ENST00000396782 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.46■■■■■ 4.55
LTB4R-202ENST00000396782 WIZO95785 1651 aa43.41■■■■■ 4.54
LTB4R-202ENST00000396782 NCAPD3P42695 1498 aa43.31■■■■■ 4.52
LTB4R-202ENST00000396782 HMGXB3Q12766 1538 aa43.19■■■■■ 4.5
LTB4R-202ENST00000396782 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
LTB4R-202ENST00000396782 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
LTB4R-202ENST00000396782 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
LTB4R-202ENST00000396782 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.45■■■■■ 4.39
LTB4R-202ENST00000396782 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.11■■■■■ 4.33
LTB4R-202ENST00000396782 NESP48681 1621 aa42.09■■■■■ 4.33
LTB4R-202ENST00000396782 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.07■■■■■ 4.33
LTB4R-202ENST00000396782 CFTRP13569 1480 aa42.02■■■■■ 4.32
LTB4R-202ENST00000396782 PRDM2Q13029 1718 aa41.82■■■■■ 4.29
LTB4R-202ENST00000396782 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.76■■■■■ 4.28
LTB4R-202ENST00000396782 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.65■■■■■ 4.26
LTB4R-202ENST00000396782 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.64■■■■■ 4.26
LTB4R-202ENST00000396782 ERCC6Q03468 1493 aa41.64■■■■■ 4.26
LTB4R-202ENST00000396782 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.52■■■■■ 4.24
LTB4R-202ENST00000396782 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.28■■■■■ 4.2
LTB4R-202ENST00000396782 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
LTB4R-202ENST00000396782 ABCC8Q09428 1581 aa41.18■■■■■ 4.18
LTB4R-202ENST00000396782 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
LTB4R-202ENST00000396782 WDR62O43379 1518 aa41.12■■■■■ 4.17
LTB4R-202ENST00000396782 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.09■■■■■ 4.17
LTB4R-202ENST00000396782 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
LTB4R-202ENST00000396782 TOPBP1Q92547 1522 aa41.07■■■■■ 4.16
LTB4R-202ENST00000396782 CUX1P39880 1505 aa41.05■■■■■ 4.16
LTB4R-202ENST00000396782 SYNJ1O43426 1573 aa40.96■■■■■ 4.15
LTB4R-202ENST00000396782 TOP2BQ02880 1626 aa40.91■■■■■ 4.14
LTB4R-202ENST00000396782 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.9■■■■■ 4.14
LTB4R-202ENST00000396782 CUX2O14529 1486 aa40.86■■■■■ 4.13
LTB4R-202ENST00000396782 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.8■■■■■ 4.12
LTB4R-202ENST00000396782 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
LTB4R-202ENST00000396782 TRIM41Q8WV44 630 aa40.67■■■■■ 4.1
LTB4R-202ENST00000396782 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.66■■■■■ 4.1
LTB4R-202ENST00000396782 SOGA1O94964 1423 aa40.61■■■■■ 4.09
LTB4R-202ENST00000396782 IFT140Q96RY7 1462 aa40.6■■■■■ 4.09
LTB4R-202ENST00000396782 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.6■■■■■ 4.09
LTB4R-202ENST00000396782 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
LTB4R-202ENST00000396782 WDR97A6NE52 1622 aa40.43■■■■■ 4.06
LTB4R-202ENST00000396782 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
LTB4R-202ENST00000396782 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
LTB4R-202ENST00000396782 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
LTB4R-202ENST00000396782 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
LTB4R-202ENST00000396782 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.26■■■■■ 4.04
LTB4R-202ENST00000396782 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.21■■■■■ 4.03
LTB4R-202ENST00000396782 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.16■■■■■ 4.02
LTB4R-202ENST00000396782 KIF27Q86VH2 1401 aa40.15■■■■■ 4.02
LTB4R-202ENST00000396782 PBRM1Q86U86 1689 aa40.07■■■■■ 4
LTB4R-202ENST00000396782 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.05■■■■■ 4
LTB4R-202ENST00000396782 GRIN2BQ13224 1484 aa40.04■■■■■ 4
LTB4R-202ENST00000396782 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
LTB4R-202ENST00000396782 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.9■■■■□ 3.98
LTB4R-202ENST00000396782 IGF1RP08069 1367 aa39.88■■■■□ 3.98
LTB4R-202ENST00000396782 EEA1Q15075 1411 aa39.88■■■■□ 3.97
LTB4R-202ENST00000396782 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
LTB4R-202ENST00000396782 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
LTB4R-202ENST00000396782 ADAMTS12P58397 1594 aa39.77■■■■□ 3.96
LTB4R-202ENST00000396782 CUL7Q14999 1698 aa39.76■■■■□ 3.96
LTB4R-202ENST00000396782 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.73■■■■□ 3.95
LTB4R-202ENST00000396782 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.71■■■■□ 3.95
LTB4R-202ENST00000396782 SYNJ2O15056 1496 aa39.69■■■■□ 3.94
LTB4R-202ENST00000396782 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.67■■■■□ 3.94
LTB4R-202ENST00000396782 FBLN2P98095 1184 aa39.65■■■■□ 3.94
LTB4R-202ENST00000396782 CHD1O14646 1710 aa39.64■■■■□ 3.94
LTB4R-202ENST00000396782 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
LTB4R-202ENST00000396782 PRXQ9BXM0 1461 aa39.57■■■■□ 3.92
LTB4R-202ENST00000396782 GRIN2AQ12879 1464 aa39.54■■■■□ 3.92
LTB4R-202ENST00000396782 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.53■■■■□ 3.92
LTB4R-202ENST00000396782 KIF21BO75037 1637 aa39.44■■■■□ 3.9
LTB4R-202ENST00000396782 OSCARQ8IYS5 282 aa39.33■■■■□ 3.89
LTB4R-202ENST00000396782 CEP170Q5SW79 1584 aa39.32■■■■□ 3.89
LTB4R-202ENST00000396782 NUP160Q12769 1436 aa39.31■■■■□ 3.88
LTB4R-202ENST00000396782 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.3■■■■□ 3.88
LTB4R-202ENST00000396782 GOLGA3Q08378 1498 aa39.27■■■■□ 3.88
LTB4R-202ENST00000396782 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.16■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms