RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493826.1

ATP11B-209, Transcript of ATPase phospholipid transporting 11B (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP11B, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11B-209ENST00000493826 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.34■■■■■ 7.09
ATP11B-209ENST00000493826 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.39■■■■■ 6.14
ATP11B-209ENST00000493826 ABCC9O60706 1549 aa53.31■■■■■ 6.12
ATP11B-209ENST00000493826 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.79■■■■■ 5.72
ATP11B-209ENST00000493826 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
ATP11B-209ENST00000493826 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.98■■■■■ 5.59
ATP11B-209ENST00000493826 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.93■■■■■ 5.58
ATP11B-209ENST00000493826 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.73■■■■■ 5.55
ATP11B-209ENST00000493826 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.69■■■■■ 5.55
ATP11B-209ENST00000493826 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.54■■■■■ 5.52
ATP11B-209ENST00000493826 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.3■■■■■ 5.48
ATP11B-209ENST00000493826 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
ATP11B-209ENST00000493826 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.06■■■■■ 5.44
ATP11B-209ENST00000493826 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.7■■■■■ 5.39
ATP11B-209ENST00000493826 SCRIBQ14160 1630 aa48.57■■■■■ 5.37
ATP11B-209ENST00000493826 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.21■■■■■ 5.31
ATP11B-209ENST00000493826 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
ATP11B-209ENST00000493826 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.05■■■■■ 5.28
ATP11B-209ENST00000493826 NCAPD3P42695 1498 aa46.51■■■■■ 5.04
ATP11B-209ENST00000493826 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.36■■■■■ 5.01
ATP11B-209ENST00000493826 SMARCA4P51532 1647 aa46.35■■■■■ 5.01
ATP11B-209ENST00000493826 SMARCA2P51531 1590 aa46.27■■■■■ 5
ATP11B-209ENST00000493826 HMGXB3Q12766 1538 aa46.23■■■■■ 4.99
ATP11B-209ENST00000493826 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
ATP11B-209ENST00000493826 ERCC6Q03468 1493 aa46.06■■■■■ 4.96
ATP11B-209ENST00000493826 CUX2O14529 1486 aa46.05■■■■■ 4.96
ATP11B-209ENST00000493826 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.98■■■■■ 4.95
ATP11B-209ENST00000493826 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.92■■■■■ 4.94
ATP11B-209ENST00000493826 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.92■■■■■ 4.94
ATP11B-209ENST00000493826 NESP48681 1621 aa45.77■■■■■ 4.92
ATP11B-209ENST00000493826 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.71■■■■■ 4.91
ATP11B-209ENST00000493826 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.53■■■■■ 4.88
ATP11B-209ENST00000493826 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.43■■■■■ 4.86
ATP11B-209ENST00000493826 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.28■■■■■ 4.84
ATP11B-209ENST00000493826 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.21■■■■■ 4.83
ATP11B-209ENST00000493826 WIZO95785 1651 aa45.17■■■■■ 4.82
ATP11B-209ENST00000493826 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.07■■■■■ 4.8
ATP11B-209ENST00000493826 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.85■■■■■ 4.77
ATP11B-209ENST00000493826 WDR62O43379 1518 aa44.78■■■■■ 4.76
ATP11B-209ENST00000493826 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
ATP11B-209ENST00000493826 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.66■■■■■ 4.74
ATP11B-209ENST00000493826 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
ATP11B-209ENST00000493826 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.59■■■■■ 4.73
ATP11B-209ENST00000493826 CFTRP13569 1480 aa44.58■■■■■ 4.73
ATP11B-209ENST00000493826 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
ATP11B-209ENST00000493826 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
ATP11B-209ENST00000493826 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.06■■■■■ 4.64
ATP11B-209ENST00000493826 TRIM41Q8WV44 630 aa43.9■■■■■ 4.62
ATP11B-209ENST00000493826 OSCARQ8IYS5 282 aa43.81■■■■■ 4.6
ATP11B-209ENST00000493826 IFT140Q96RY7 1462 aa43.76■■■■■ 4.6
ATP11B-209ENST00000493826 TOPBP1Q92547 1522 aa43.74■■■■■ 4.59
ATP11B-209ENST00000493826 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
ATP11B-209ENST00000493826 ABCC8Q09428 1581 aa43.65■■■■■ 4.58
ATP11B-209ENST00000493826 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.61■■■■■ 4.57
ATP11B-209ENST00000493826 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
ATP11B-209ENST00000493826 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
ATP11B-209ENST00000493826 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
ATP11B-209ENST00000493826 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
ATP11B-209ENST00000493826 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
ATP11B-209ENST00000493826 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
ATP11B-209ENST00000493826 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.23■■■■■ 4.516e-7■■□□□ 11.9
ATP11B-209ENST00000493826 ARHGEF11O15085 1522 aa43.21■■■■■ 4.51
ATP11B-209ENST00000493826 CHD1O14646 1710 aa43.2■■■■■ 4.51
ATP11B-209ENST00000493826 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.09■■■■■ 4.49
ATP11B-209ENST00000493826 SOGA1O94964 1423 aa43.04■■■■■ 4.48
ATP11B-209ENST00000493826 WDR97A6NE52 1622 aa43■■■■■ 4.47
ATP11B-209ENST00000493826 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43■■■■■ 4.47
ATP11B-209ENST00000493826 CUX1P39880 1505 aa42.96■■■■■ 4.47
ATP11B-209ENST00000493826 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
ATP11B-209ENST00000493826 FBLN2P98095 1184 aa42.9■■■■■ 4.46
ATP11B-209ENST00000493826 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.85■■■■■ 4.45
ATP11B-209ENST00000493826 ARAP1Q96P48 1450 aa42.78■■■■■ 4.44
ATP11B-209ENST00000493826 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.77■■■■■ 4.44
ATP11B-209ENST00000493826 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
ATP11B-209ENST00000493826 GRIN2BQ13224 1484 aa42.73■■■■■ 4.43
ATP11B-209ENST00000493826 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.69■■■■■ 4.42
ATP11B-209ENST00000493826 SYNJ1O43426 1573 aa42.66■■■■■ 4.42
ATP11B-209ENST00000493826 PBRM1Q86U86 1689 aa42.63■■■■■ 4.41
ATP11B-209ENST00000493826 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
ATP11B-209ENST00000493826 SYNJ2O15056 1496 aa42.6■■■■■ 4.41
ATP11B-209ENST00000493826 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
ATP11B-209ENST00000493826 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.55■■■■■ 4.4
ATP11B-209ENST00000493826 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.53■■■■■ 4.4
ATP11B-209ENST00000493826 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.52■■■■■ 4.4
ATP11B-209ENST00000493826 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
ATP11B-209ENST00000493826 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.31■■■■■ 4.36
ATP11B-209ENST00000493826 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.3■■■■■ 4.36
ATP11B-209ENST00000493826 TOP2BQ02880 1626 aa42.28■■■■■ 4.36
ATP11B-209ENST00000493826 ADAMTS12P58397 1594 aa42.21■■■■■ 4.35
ATP11B-209ENST00000493826 GRIN2AQ12879 1464 aa42.18■■■■■ 4.34
ATP11B-209ENST00000493826 CEP170Q5SW79 1584 aa42.05■■■■■ 4.32
ATP11B-209ENST00000493826 NUP160Q12769 1436 aa42.05■■■■■ 4.32
ATP11B-209ENST00000493826 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.02■■■■■ 4.32
ATP11B-209ENST00000493826 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.01■■■■■ 4.32
ATP11B-209ENST00000493826 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.97■■■■■ 4.31
ATP11B-209ENST00000493826 SHROOM2Q13796 1616 aa41.91■■■■■ 4.3
ATP11B-209ENST00000493826 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.62■■■■■ 4.25
ATP11B-209ENST00000493826 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
ATP11B-209ENST00000493826 JPH4Q96JJ6 628 aa41.51■■■■■ 4.24
ATP11B-209ENST00000493826 CUL7Q14999 1698 aa41.42■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms