Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERVW-1Q9UQF0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ERVW-1Q9UQF0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ERVW-1Q9UQF0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERVW-1Q9UQF0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ERVW-1Q9UQF0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
ERVW-1Q9UQF0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERVW-1Q9UQF0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ERVW-1Q9UQF0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ERVW-1Q9UQF0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
ERVW-1Q9UQF0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ERVW-1Q9UQF0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERVW-1Q9UQF0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERVW-1Q9UQF0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ERVW-1Q9UQF0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ERVW-1Q9UQF0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ERVW-1Q9UQF0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ERVW-1Q9UQF0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
ERVW-1Q9UQF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ERVW-1Q9UQF0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ERVW-1Q9UQF0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERVW-1Q9UQF0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ERVW-1Q9UQF0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ERVW-1Q9UQF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ERVW-1Q9UQF0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ERVW-1Q9UQF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ERVW-1Q9UQF0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERVW-1Q9UQF0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERVW-1Q9UQF0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERVW-1Q9UQF0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ERVW-1Q9UQF0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ERVW-1Q9UQF0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERVW-1Q9UQF0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERVW-1Q9UQF0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ERVW-1Q9UQF0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVW-1Q9UQF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERVW-1Q9UQF0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVW-1Q9UQF0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ERVW-1Q9UQF0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ERVW-1Q9UQF0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ERVW-1Q9UQF0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ERVW-1Q9UQF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ERVW-1Q9UQF0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVW-1Q9UQF0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ERVW-1Q9UQF0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ERVW-1Q9UQF0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ERVW-1Q9UQF0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ERVW-1Q9UQF0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ERVW-1Q9UQF0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ERVW-1Q9UQF0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ERVW-1Q9UQF0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERVW-1Q9UQF0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ERVW-1Q9UQF0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVW-1Q9UQF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ERVW-1Q9UQF0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVW-1Q9UQF0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVW-1Q9UQF0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVW-1Q9UQF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVW-1Q9UQF0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVW-1Q9UQF0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVW-1Q9UQF0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ERVW-1Q9UQF0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERVW-1Q9UQF0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ERVW-1Q9UQF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ERVW-1Q9UQF0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERVW-1Q9UQF0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERVW-1Q9UQF0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVW-1Q9UQF0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERVW-1Q9UQF0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVW-1Q9UQF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVW-1Q9UQF0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVW-1Q9UQF0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVW-1Q9UQF0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVW-1Q9UQF0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVW-1Q9UQF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVW-1Q9UQF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERVW-1Q9UQF0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVW-1Q9UQF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVW-1Q9UQF0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVW-1Q9UQF0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVW-1Q9UQF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms