Protein–RNA interactions for Protein: Q8N114

SHISA5, Protein shisa-5, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA5Q8N114 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA5Q8N114 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA5Q8N114 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SHISA5Q8N114 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SHISA5Q8N114 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms