Protein–RNA interactions for Protein: Q12849

GRSF1, G-rich sequence factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRSF1Q12849 CTDSPL-204ENST00000435525 371 ntTSL 317.03■□□□□ 0.326e-11■■■□□ 14.8
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GRSF1Q12849 PIM1-203ENST00000479509 675 ntTSL 213.03□□□□□ -0.322e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PIM1-202ENST00000468243 818 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.572e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-9■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-9■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PCGF5-202ENST00000490164 973 ntTSL 218.16■□□□□ 0.52e-8■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.512e-8■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-10■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.046e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-211ENST00000435855 2281 ntTSL 221.51■■□□□ 1.036e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.856e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.796e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.776e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.626e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 NEU4-217ENST00000618597 3013 ntTSL 218.36■□□□□ 0.536e-13■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.154e-11■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.363e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.333e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 516.78■□□□□ 0.283e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.123e-14■■■□□ 14.8
GRSF1Q12849 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 ELAVL1-204ENST00000596154 880 ntTSL 38.67□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 414.84□□□□□ -0.031e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.611e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.85□□□□□ -1.631e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 54.77□□□□□ -1.651e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 FAM20C-205ENST00000515795 2177 ntTSL 1 (best)19.51■□□□□ 0.718e-7■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.161e-19■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-19■■■□□ 14.7
GRSF1Q12849 CBFB-205ENST00000564034 509 ntTSL 224.35■■□□□ 1.493e-7■■■□□ 14.6
GRSF1Q12849 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.853e-7■■■□□ 14.6
GRSF1Q12849 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-7■■■□□ 14.6
GRSF1Q12849 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-7■■■□□ 14.6
GRSF1Q12849 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.014e-10■■■□□ 14.6
GRSF1Q12849 RCC1L-204ENST00000616051 1610 ntTSL 228.34■■■□□ 2.132e-7■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.082e-7■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.742e-7■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.622e-7■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-10■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 SMCO4-203ENST00000526869 374 ntTSL 1 (best)20.33■□□□□ 0.851e-10■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 RCC1L-203ENST00000615250 592 ntTSL 414.96□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-6■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■□□□ 14.5
GRSF1Q12849 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.279e-12■■□□□ 14.4
GRSF1Q12849 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.014e-14■■□□□ 14.4
GRSF1Q12849 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-14■■□□□ 14.4
GRSF1Q12849 RPS14-205ENST00000519690 3119 ntTSL 214.56□□□□□ -0.084e-14■■□□□ 14.4
GRSF1Q12849 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.524e-14■■□□□ 14.4
GRSF1Q12849 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.36e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AP006621.3-201ENST00000526588 291 ntTSL 221.08■□□□□ 0.976e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.576e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-210ENST00000599159 1400 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.364e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-203ENST00000594309 603 ntTSL 223.15■■□□□ 1.34e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-211ENST00000601274 877 ntTSL 523.15■■□□□ 1.34e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-209ENST00000599134 500 ntTSL 522.15■■□□□ 1.144e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.944e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-208ENST00000598417 581 ntTSL 519.99■□□□□ 0.794e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-207ENST00000597634 726 ntTSL 516.2■□□□□ 0.184e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 313.75□□□□□ -0.214e-9■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.21e-10■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.81e-10■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.536e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.116e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 MTG1-203ENST00000460848 2730 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-10■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-8■■□□□ 14.3
GRSF1Q12849 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.54□□□□□ -1.362e-8■■□□□ 14.2
GRSF1Q12849 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)19.05■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 14.2
GRSF1Q12849 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 14.2
GRSF1Q12849 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.154e-69■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.44e-69■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.274e-69■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.294e-69■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-69■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.564e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.524e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.144e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.24e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 ARMT1-204ENST00000545879 2495 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.564e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 ARMT1-201ENST00000367294 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HOXC10-205ENST00000515593 526 ntTSL 48.66□□□□□ -1.024e-7■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-205ENST00000547566 1234 ntTSL 1 (best)17.29■□□□□ 0.361e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-209ENST00000550482 832 ntTSL 215.79■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-206ENST00000547708 530 ntTSL 411.38□□□□□ -0.591e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-203ENST00000546500 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.271e-6■■□□□ 14.1
GRSF1Q12849 ATG9A-215ENST00000446716 5245 ntTSL 217.9■□□□□ 0.461e-8■■□□□ 14
GRSF1Q12849 ATG9A-220ENST00000475339 812 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-8■■□□□ 14
GRSF1Q12849 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-8■■□□□ 14
GRSF1Q12849 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.181e-8■■□□□ 14
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