Protein–RNA interactions for Protein: P52298

NCBP2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2P52298 ZFP90-217ENST00000576305 579 ntTSL 414.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZFP90-210ENST00000570884 578 ntTSL 412.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZFP90-205ENST00000564558 4664 ntTSL 1 (best)10.19□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 322.16■■□□□ 1.146e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 321.39■■□□□ 1.016e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-209ENST00000460573 443 ntTSL 520.89■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 220.74■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-213ENST00000471978 478 ntTSL 220.47■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-222ENST00000496567 1575 ntTSL 520.35■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-208ENST00000451893 514 ntTSL 319.73■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)14.64□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-217ENST00000479161 942 ntTSL 514.27□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-204ENST00000424143 1605 ntTSL 214.25□□□□□ -0.136e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.256e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-210ENST00000462125 961 ntTSL 312.05□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.666e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.371e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 SAMD10-203ENST00000478694 801 ntTSL 217.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-211ENST00000490746 589 ntTSL 516.11■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-208ENST00000485891 479 ntTSL 514.97□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-206ENST00000432649 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZNF556-203ENST00000586470 567 ntTSL 313.55□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 SAMD10-204ENST00000498830 823 ntTSL 212.65□□□□□ -0.381e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 38.43□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 EVA1A-210ENST00000486696 585 ntTSL 36.57□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.1
NCBP2P52298 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.722e-9■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ARHGAP5-208ENST00000555814 583 ntTSL 48.52□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.642e-9■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.682e-9■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-225ENST00000585084 997 ntTSL 325.91■■□□□ 1.747e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-223ENST00000584229 535 ntTSL 323.22■■□□□ 1.317e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.217e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.127e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.077e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.037e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 220.7■□□□□ 0.97e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-219ENST00000542908 1178 ntTSL 220.7■□□□□ 0.97e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-202ENST00000435507 2254 ntTSL 220.63■□□□□ 0.897e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 HPS3-207ENST00000494327 556 ntTSL 320.16■□□□□ 0.827e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 319.47■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.77e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 HPS3-206ENST00000486530 1894 ntTSL 519.27■□□□□ 0.687e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-208ENST00000446292 1066 ntTSL 318.11■□□□□ 0.497e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 217.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 MARF1-206ENST00000548216 2529 ntTSL 517.41■□□□□ 0.387e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 HPS3-204ENST00000462030 2486 ntTSL 217.3■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-214ENST00000540567 1492 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.357e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-214ENST00000581418 580 ntTSL 216.97■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.317e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-218ENST00000557439 2599 ntTSL 516.74■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 416.51■□□□□ 0.237e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-221ENST00000583961 581 ntTSL 516.38■□□□□ 0.217e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-216ENST00000582327 561 ntTSL 416.01■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 416.01■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.097e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 215.53■□□□□ 0.087e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-215ENST00000555964 562 ntTSL 415.25■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.037e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 415.2■□□□□ 0.027e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-204ENST00000553361 746 ntTSL 515□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 414.98□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.047e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 514.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-220ENST00000544490 3731 ntTSL 214.35□□□□□ -0.117e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-207ENST00000440641 909 ntTSL 314.17□□□□□ -0.147e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 214.17□□□□□ -0.147e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 GPS1-211ENST00000580627 543 ntTSL 414.07□□□□□ -0.167e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.177e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 DMAP1-205ENST00000436069 599 ntTSL 313.66□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 LARP4B-207ENST00000476529 613 ntTSL 313.51□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 ATG16L2-203ENST00000439504 3841 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 26.9
NCBP2P52298 XRCC3-203ENST00000553332 560 ntTSL 313.21□□□□□ -0.297e-8■■■■■ 26.9
Retrieved 100 of 18,329 protein–RNA pairs in 220.9 ms