RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.75	■■■■■ 7.15
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.07	■■■■■ 6.09
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC9	O60706	1549 aa		51.53	■■■■■ 5.84
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.89	■■■■■ 5.58
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.87	■■■■■ 5.57
GPS1-223	ENST00000584229	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		49.74	■■■■■ 5.55
GPS1-223	ENST00000584229	NACAD	O15069	1562 aa		49.7	■■■■■ 5.55
GPS1-223	ENST00000584229	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.4	■■■■■ 5.5
GPS1-223	ENST00000584229	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.38	■■■■■ 5.5
GPS1-223	ENST00000584229	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		48.78	■■■■■ 5.4
GPS1-223	ENST00000584229	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.54	■■■■■ 5.36
GPS1-223	ENST00000584229	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.15	■■■■■ 5.3
GPS1-223	ENST00000584229	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.15	■■■■■ 5.3
GPS1-223	ENST00000584229	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		47.6	■■■■■ 5.21
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.9	■■■■■ 5.1
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.74	■■■■■ 5.07
GPS1-223	ENST00000584229	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		46.64	■■■■■ 5.06
GPS1-223	ENST00000584229	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		46.51	■■■■■ 5.04
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.38	■■■■■ 5.01
GPS1-223	ENST00000584229	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.34	■■■■■ 5.01
GPS1-223	ENST00000584229	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.09	■■■■■ 4.97
GPS1-223	ENST00000584229	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.94	■■■■■ 4.94
GPS1-223	ENST00000584229	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.9	■■■■■ 4.94
GPS1-223	ENST00000584229	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.79	■■■■■ 4.92
GPS1-223	ENST00000584229	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.75	■■■■■ 4.91
GPS1-223	ENST00000584229	WIZ	O95785	1651 aa		45.73	■■■■■ 4.91
GPS1-223	ENST00000584229	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.68	■■■■■ 4.9
GPS1-223	ENST00000584229	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.65	■■■■■ 4.9
GPS1-223	ENST00000584229	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.63	■■■■■ 4.9
GPS1-223	ENST00000584229	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.19	■■■■■ 4.82
GPS1-223	ENST00000584229	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.93	■■■■■ 4.78
GPS1-223	ENST00000584229	NES	P48681	1621 aa		44.69	■■■■■ 4.74
GPS1-223	ENST00000584229	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.63	■■■■■ 4.73
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.59	■■■■■ 4.73
GPS1-223	ENST00000584229	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.47	■■■■■ 4.71
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC6	Q03468	1493 aa		44.43	■■■■■ 4.7
GPS1-223	ENST00000584229	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.33	■■■■■ 4.69
GPS1-223	ENST00000584229	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.32	■■■■■ 4.69
GPS1-223	ENST00000584229	CFTR	P13569	1480 aa		44.3	■■■■■ 4.68
GPS1-223	ENST00000584229	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.25	■■■■■ 4.67
GPS1-223	ENST00000584229	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.06	■■■■■ 4.64
GPS1-223	ENST00000584229	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.01	■■■■■ 4.64
GPS1-223	ENST00000584229	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.97	■■■■■ 4.63
GPS1-223	ENST00000584229	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.83	■■■■■ 4.61
GPS1-223	ENST00000584229	CUX2	O14529	1486 aa		43.69	■■■■■ 4.58
GPS1-223	ENST00000584229	WDR62	O43379	1518 aa		43.66	■■■■■ 4.58
GPS1-223	ENST00000584229	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
GPS1-223	ENST00000584229	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.43	■■■■■ 4.54
GPS1-223	ENST00000584229	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.4	■■■■■ 4.54
GPS1-223	ENST00000584229	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.37	■■■■■ 4.53
GPS1-223	ENST00000584229	CUX1	P39880	1505 aa		43.22	■■■■■ 4.51
GPS1-223	ENST00000584229	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.09	■■■■■ 4.49
GPS1-223	ENST00000584229	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.05	■■■■■ 4.48
GPS1-223	ENST00000584229	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.05	■■■■■ 4.48
GPS1-223	ENST00000584229	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.03	■■■■■ 4.48
GPS1-223	ENST00000584229	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		43.03	■■■■■ 4.48
GPS1-223	ENST00000584229	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43	■■■■■ 4.47
GPS1-223	ENST00000584229	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.99	■■■■■ 4.47
GPS1-223	ENST00000584229	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.91	■■■■■ 4.46
GPS1-223	ENST00000584229	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GPS1-223	ENST00000584229	SOGA1	O94964	1423 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
GPS1-223	ENST00000584229	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
GPS1-223	ENST00000584229	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.75	■■■■■ 4.43
GPS1-223	ENST00000584229	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.6	■■■■■ 4.41
GPS1-223	ENST00000584229	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.58	■■■■■ 4.41
GPS1-223	ENST00000584229	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.57	■■■■■ 4.41
GPS1-223	ENST00000584229	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.49	■■■■■ 4.39
GPS1-223	ENST00000584229	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.46	■■■■■ 4.39
GPS1-223	ENST00000584229	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.4	■■■■■ 4.38
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.36	■■■■■ 4.37
GPS1-223	ENST00000584229	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.32	■■■■■ 4.37
GPS1-223	ENST00000584229	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GPS1-223	ENST00000584229	CHD1	O14646	1710 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GPS1-223	ENST00000584229	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
GPS1-223	ENST00000584229	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GPS1-223	ENST00000584229	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-223	ENST00000584229	FBLN2	P98095	1184 aa		42.1	■■■■■ 4.33
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.05	■■■■■ 4.32
GPS1-223	ENST00000584229	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.03	■■■■■ 4.32
GPS1-223	ENST00000584229	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.01	■■■■■ 4.32
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
GPS1-223	ENST00000584229	CUL7	Q14999	1698 aa		41.92	■■■■■ 4.3
GPS1-223	ENST00000584229	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.91	■■■■■ 4.3
GPS1-223	ENST00000584229	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.9	■■■■■ 4.3
GPS1-223	ENST00000584229	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.88	■■■■■ 4.3
GPS1-223	ENST00000584229	IGF1R	P08069	1367 aa		41.82	■■■■■ 4.29
GPS1-223	ENST00000584229	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.8	■■■■■ 4.28
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.77	■■■■■ 4.28
GPS1-223	ENST00000584229	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		41.65	■■■■■ 4.26
GPS1-223	ENST00000584229	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.63	■■■■■ 4.25
GPS1-223	ENST00000584229	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		41.59	■■■■■ 4.25
GPS1-223	ENST00000584229	EEA1	Q15075	1411 aa		41.58	■■■■■ 4.25
GPS1-223	ENST00000584229	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.57	■■■■■ 4.25
GPS1-223	ENST00000584229	NUP160	Q12769	1436 aa		41.52	■■■■■ 4.24
GPS1-223	ENST00000584229	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		41.49	■■■■■ 4.23
GPS1-223	ENST00000584229	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.44	■■■■■ 4.22
GPS1-223	ENST00000584229	PRX	Q9BXM0	1461 aa		41.37	■■■■■ 4.21
GPS1-223	ENST00000584229	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		41.36	■■■■■ 4.21
GPS1-223	ENST00000584229	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		41.36	■■■■■ 4.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms