RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-223ENST00000584229 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.75■■■■■ 7.15
GPS1-223ENST00000584229 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.07■■■■■ 6.09
GPS1-223ENST00000584229 ABCC9O60706 1549 aa51.53■■■■■ 5.84
GPS1-223ENST00000584229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.89■■■■■ 5.58
GPS1-223ENST00000584229 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.87■■■■■ 5.57
GPS1-223ENST00000584229 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.74■■■■■ 5.55
GPS1-223ENST00000584229 NACADO15069 1562 aa49.7■■■■■ 5.55
GPS1-223ENST00000584229 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.4■■■■■ 5.5
GPS1-223ENST00000584229 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.38■■■■■ 5.5
GPS1-223ENST00000584229 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.78■■■■■ 5.4
GPS1-223ENST00000584229 SCRIBQ14160 1630 aa48.54■■■■■ 5.36
GPS1-223ENST00000584229 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.15■■■■■ 5.3
GPS1-223ENST00000584229 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.15■■■■■ 5.3
GPS1-223ENST00000584229 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.6■■■■■ 5.21
GPS1-223ENST00000584229 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
GPS1-223ENST00000584229 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.74■■■■■ 5.07
GPS1-223ENST00000584229 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.64■■■■■ 5.06
GPS1-223ENST00000584229 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
GPS1-223ENST00000584229 SMARCA4P51532 1647 aa46.38■■■■■ 5.01
GPS1-223ENST00000584229 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.34■■■■■ 5.01
GPS1-223ENST00000584229 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.09■■■■■ 4.97
GPS1-223ENST00000584229 SMARCA2P51531 1590 aa45.94■■■■■ 4.94
GPS1-223ENST00000584229 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.9■■■■■ 4.94
GPS1-223ENST00000584229 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.79■■■■■ 4.92
GPS1-223ENST00000584229 NCAPD3P42695 1498 aa45.75■■■■■ 4.91
GPS1-223ENST00000584229 WIZO95785 1651 aa45.73■■■■■ 4.91
GPS1-223ENST00000584229 HMGXB3Q12766 1538 aa45.68■■■■■ 4.9
GPS1-223ENST00000584229 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
GPS1-223ENST00000584229 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
GPS1-223ENST00000584229 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
GPS1-223ENST00000584229 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
GPS1-223ENST00000584229 NESP48681 1621 aa44.69■■■■■ 4.74
GPS1-223ENST00000584229 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.63■■■■■ 4.73
GPS1-223ENST00000584229 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.59■■■■■ 4.73
GPS1-223ENST00000584229 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.47■■■■■ 4.71
GPS1-223ENST00000584229 ERCC6Q03468 1493 aa44.43■■■■■ 4.7
GPS1-223ENST00000584229 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.33■■■■■ 4.69
GPS1-223ENST00000584229 PRDM2Q13029 1718 aa44.32■■■■■ 4.69
GPS1-223ENST00000584229 CFTRP13569 1480 aa44.3■■■■■ 4.68
GPS1-223ENST00000584229 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.25■■■■■ 4.67
GPS1-223ENST00000584229 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.06■■■■■ 4.64
GPS1-223ENST00000584229 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.01■■■■■ 4.64
GPS1-223ENST00000584229 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
GPS1-223ENST00000584229 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.83■■■■■ 4.61
GPS1-223ENST00000584229 CUX2O14529 1486 aa43.69■■■■■ 4.58
GPS1-223ENST00000584229 WDR62O43379 1518 aa43.66■■■■■ 4.58
GPS1-223ENST00000584229 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
GPS1-223ENST00000584229 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.43■■■■■ 4.54
GPS1-223ENST00000584229 TOPBP1Q92547 1522 aa43.4■■■■■ 4.54
GPS1-223ENST00000584229 ABCC8Q09428 1581 aa43.37■■■■■ 4.53
GPS1-223ENST00000584229 CUX1P39880 1505 aa43.22■■■■■ 4.51
GPS1-223ENST00000584229 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.09■■■■■ 4.49
GPS1-223ENST00000584229 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
GPS1-223ENST00000584229 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.05■■■■■ 4.48
GPS1-223ENST00000584229 SYNJ1O43426 1573 aa43.03■■■■■ 4.48
GPS1-223ENST00000584229 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.03■■■■■ 4.48
GPS1-223ENST00000584229 IFT140Q96RY7 1462 aa43■■■■■ 4.47
GPS1-223ENST00000584229 TOP2BQ02880 1626 aa42.99■■■■■ 4.47
GPS1-223ENST00000584229 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
GPS1-223ENST00000584229 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.87■■■■■ 4.45
GPS1-223ENST00000584229 SOGA1O94964 1423 aa42.86■■■■■ 4.45
GPS1-223ENST00000584229 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
GPS1-223ENST00000584229 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
GPS1-223ENST00000584229 WDR97A6NE52 1622 aa42.75■■■■■ 4.43
GPS1-223ENST00000584229 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.6■■■■■ 4.41
GPS1-223ENST00000584229 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
GPS1-223ENST00000584229 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.57■■■■■ 4.41
GPS1-223ENST00000584229 PBRM1Q86U86 1689 aa42.49■■■■■ 4.39
GPS1-223ENST00000584229 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.46■■■■■ 4.39
GPS1-223ENST00000584229 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.4■■■■■ 4.38
GPS1-223ENST00000584229 TRIM41Q8WV44 630 aa42.36■■■■■ 4.37
GPS1-223ENST00000584229 GRIN2BQ13224 1484 aa42.32■■■■■ 4.37
GPS1-223ENST00000584229 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.27■■■■■ 4.36
GPS1-223ENST00000584229 CHD1O14646 1710 aa42.24■■■■■ 4.35
GPS1-223ENST00000584229 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
GPS1-223ENST00000584229 KIF27Q86VH2 1401 aa42.15■■■■■ 4.34
GPS1-223ENST00000584229 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.1■■■■■ 4.33
GPS1-223ENST00000584229 FBLN2P98095 1184 aa42.1■■■■■ 4.33
GPS1-223ENST00000584229 ADAMTS12P58397 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
GPS1-223ENST00000584229 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.03■■■■■ 4.32
GPS1-223ENST00000584229 SYNJ2O15056 1496 aa42.01■■■■■ 4.32
GPS1-223ENST00000584229 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
GPS1-223ENST00000584229 CUL7Q14999 1698 aa41.92■■■■■ 4.3
GPS1-223ENST00000584229 OSCARQ8IYS5 282 aa41.91■■■■■ 4.3
GPS1-223ENST00000584229 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.9■■■■■ 4.3
GPS1-223ENST00000584229 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.88■■■■■ 4.3
GPS1-223ENST00000584229 IGF1RP08069 1367 aa41.82■■■■■ 4.29
GPS1-223ENST00000584229 GRIN2AQ12879 1464 aa41.8■■■■■ 4.28
GPS1-223ENST00000584229 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.77■■■■■ 4.28
GPS1-223ENST00000584229 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.65■■■■■ 4.26
GPS1-223ENST00000584229 CEP170Q5SW79 1584 aa41.63■■■■■ 4.25
GPS1-223ENST00000584229 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
GPS1-223ENST00000584229 EEA1Q15075 1411 aa41.58■■■■■ 4.25
GPS1-223ENST00000584229 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.57■■■■■ 4.25
GPS1-223ENST00000584229 NUP160Q12769 1436 aa41.52■■■■■ 4.24
GPS1-223ENST00000584229 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.49■■■■■ 4.23
GPS1-223ENST00000584229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.44■■■■■ 4.22
GPS1-223ENST00000584229 PRXQ9BXM0 1461 aa41.37■■■■■ 4.21
GPS1-223ENST00000584229 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
GPS1-223ENST00000584229 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms