RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451893.5

C9orf3-208, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-208ENST00000451893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.18■■■■■ 6.1
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C9orf3-208ENST00000451893 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
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C9orf3-208ENST00000451893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.73■■■■■ 4.43
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C9orf3-208ENST00000451893 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
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C9orf3-208ENST00000451893 SMARCA2P51531 1590 aa41.36■■■■■ 4.21
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C9orf3-208ENST00000451893 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
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C9orf3-208ENST00000451893 ERCC6Q03468 1493 aa40.95■■■■■ 4.15
C9orf3-208ENST00000451893 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
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C9orf3-208ENST00000451893 WIZO95785 1651 aa40.57■■■■■ 4.09
C9orf3-208ENST00000451893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.52■■■■■ 4.08
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C9orf3-208ENST00000451893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.25■■■■■ 4.03
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C9orf3-208ENST00000451893 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.22■■■■■ 4.03
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C9orf3-208ENST00000451893 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.86■■■■□ 3.97
C9orf3-208ENST00000451893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.81■■■■□ 3.96
C9orf3-208ENST00000451893 CFTRP13569 1480 aa39.8■■■■□ 3.96
C9orf3-208ENST00000451893 WDR62O43379 1518 aa39.74■■■■□ 3.95
C9orf3-208ENST00000451893 PRDM2Q13029 1718 aa39.6■■■■□ 3.93
C9orf3-208ENST00000451893 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.58■■■■□ 3.93
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C9orf3-208ENST00000451893 IFT140Q96RY7 1462 aa39.02■■■■□ 3.84
C9orf3-208ENST00000451893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.99■■■■□ 3.83
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C9orf3-208ENST00000451893 FBLN2P98095 1184 aa38.44■■■■□ 3.74
C9orf3-208ENST00000451893 CHD1O14646 1710 aa38.42■■■■□ 3.74
C9orf3-208ENST00000451893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
C9orf3-208ENST00000451893 WDR97A6NE52 1622 aa38.36■■■■□ 3.73
C9orf3-208ENST00000451893 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-208ENST00000451893 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-208ENST00000451893 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
C9orf3-208ENST00000451893 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.24■■■■□ 3.71
C9orf3-208ENST00000451893 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
C9orf3-208ENST00000451893 ARHGEF11O15085 1522 aa38.18■■■■□ 3.7
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C9orf3-208ENST00000451893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.07■■■■□ 3.69
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C9orf3-208ENST00000451893 SYNJ1O43426 1573 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-208ENST00000451893 TOP2BQ02880 1626 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-208ENST00000451893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.02■■■■□ 3.68
C9orf3-208ENST00000451893 SYNJ2O15056 1496 aa38■■■■□ 3.67
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C9orf3-208ENST00000451893 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.95■■■■□ 3.67
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C9orf3-208ENST00000451893 ADAMTS12P58397 1594 aa37.71■■■■□ 3.63
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C9orf3-208ENST00000451893 KIF27Q86VH2 1401 aa37.36■■■■□ 3.57
C9orf3-208ENST00000451893 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.29■■■■□ 3.56
C9orf3-208ENST00000451893 SHROOM2Q13796 1616 aa37.28■■■■□ 3.56
C9orf3-208ENST00000451893 CUL7Q14999 1698 aa37.24■■■■□ 3.55
C9orf3-208ENST00000451893 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
C9orf3-208ENST00000451893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.16■■■■□ 3.54
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