RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.71■■■■■ 6.19
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C9orf3-209ENST00000460573 NACADO15069 1562 aa44.94■■■■■ 4.78
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C9orf3-209ENST00000460573 SCRIBQ14160 1630 aa43.5■■■■■ 4.55
C9orf3-209ENST00000460573 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.25■■■■■ 4.51
C9orf3-209ENST00000460573 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.73■■■■■ 4.43
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C9orf3-209ENST00000460573 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.57■■■■■ 4.41
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C9orf3-209ENST00000460573 SMARCA2P51531 1590 aa41.36■■■■■ 4.21
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C9orf3-209ENST00000460573 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.35■■■■■ 4.21
C9orf3-209ENST00000460573 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.2■■■■■ 4.19
C9orf3-209ENST00000460573 HMGXB3Q12766 1538 aa41.19■■■■■ 4.18
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C9orf3-209ENST00000460573 WIZO95785 1651 aa40.91■■■■■ 4.14
C9orf3-209ENST00000460573 NESP48681 1621 aa40.67■■■■■ 4.1
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C9orf3-209ENST00000460573 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.25■■■■■ 4.03
C9orf3-209ENST00000460573 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.22■■■■■ 4.03
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C9orf3-209ENST00000460573 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.07■■■■■ 4.01
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C9orf3-209ENST00000460573 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.86■■■■□ 3.97
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C9orf3-209ENST00000460573 IFT140Q96RY7 1462 aa39.02■■■■□ 3.84
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C9orf3-209ENST00000460573 TOP2BQ02880 1626 aa38.59■■■■□ 3.77
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C9orf3-209ENST00000460573 SYNJ1O43426 1573 aa38.54■■■■□ 3.76
C9orf3-209ENST00000460573 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.54■■■■□ 3.76
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C9orf3-209ENST00000460573 CHD1O14646 1710 aa38.42■■■■□ 3.74
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C9orf3-209ENST00000460573 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.29■■■■□ 3.72
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C9orf3-209ENST00000460573 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
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C9orf3-209ENST00000460573 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
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C9orf3-209ENST00000460573 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.95■■■■□ 3.67
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C9orf3-209ENST00000460573 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.9■■■■□ 3.66
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C9orf3-209ENST00000460573 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
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C9orf3-209ENST00000460573 CEP170Q5SW79 1584 aa37.5■■■■□ 3.59
C9orf3-209ENST00000460573 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.49■■■■□ 3.59
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