RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623691.3

GPS1-226, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene GPS1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-226ENST00000623691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.55■■■■□ 3.6
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GPS1-226ENST00000623691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.75■■□□□ 1.87
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GPS1-226ENST00000623691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.53■■□□□ 1.84
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GPS1-226ENST00000623691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.42■■□□□ 1.823e-8■□□□□ 10.6
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GPS1-226ENST00000623691 CUL7Q14999 1698 aa26.35■■□□□ 1.81
GPS1-226ENST00000623691 HRCP23327 699 aa26.32■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 GRIN2BQ13224 1484 aa26.31■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.28■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.27■■□□□ 1.8
GPS1-226ENST00000623691 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
GPS1-226ENST00000623691 ADAMTS12P58397 1594 aa26.22■■□□□ 1.79
GPS1-226ENST00000623691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.21■■□□□ 1.79
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