Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.294e-9■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 SH3GLB2-208ENST00000455407 837 ntTSL 227.17■■□□□ 1.944e-9■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 525.21■■□□□ 1.634e-9■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-9■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.444e-9■■□□□ 12.1
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PRPF4O43172 APOL1-202ENST00000397278 2918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.697e-12■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 APOL1-205ENST00000422706 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.87e-12■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.927e-12■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 APOL1-201ENST00000319136 3000 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.067e-12■■□□□ 12.1
PRPF4O43172 IGF2BP2-205ENST00000461957 509 ntTSL 513.2□□□□□ -0.34e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.414e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 211.62□□□□□ -0.554e-9■■□□□ 12
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PRPF4O43172 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 310.89□□□□□ -0.674e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 27.63□□□□□ -1.197e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.337e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.327e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.297e-7■■□□□ 12
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