Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.019e-13■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.969e-13■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.929e-13■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TRIR-203ENST00000589590 930 ntTSL 216.38■□□□□ 0.219e-13■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-36■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.032e-36■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-36■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.972e-9■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.623e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.282e-11■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 HECTD3-201ENST00000372168 2530 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.682e-11■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 HECTD3-205ENST00000486132 2385 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.692e-11■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 RAB40C-212ENST00000569575 692 ntTSL 222.7■■□□□ 1.224e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.221e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.081e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-225ENST00000557415 584 ntTSL 220.99■□□□□ 0.951e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-205ENST00000421938 565 ntTSL 320.36■□□□□ 0.851e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.831e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 320.04■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 419.3■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-216ENST00000554867 555 ntTSL 219.02■□□□□ 0.641e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-212ENST00000553787 579 ntTSL 418.67■□□□□ 0.581e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-224ENST00000557015 628 ntTSL 218.61■□□□□ 0.571e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-222ENST00000556426 563 ntTSL 318.52■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.354e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 316.53■□□□□ 0.244e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-214ENST00000553915 1931 ntTSL 215.47■□□□□ 0.071e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TRIM24-206ENST00000497516 1515 ntTSL 513.9□□□□□ -0.198e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LPIN3-202ENST00000445975 808 ntTSL 512.56□□□□□ -0.48e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LPIN3-201ENST00000373257 4363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.528e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 CSE1L-201ENST00000262982 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-14■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.654e-14■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-211ENST00000553641 800 ntTSL 310.84□□□□□ -0.671e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LPIN3-205ENST00000632009 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.818e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LPIN3-204ENST00000496565 568 ntTSL 39.26□□□□□ -0.938e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 SH3BP4-208ENST00000462602 257 ntTSL 59.11□□□□□ -0.958e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-223ENST00000556616 571 ntTSL 47.27□□□□□ -1.251e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LRPPRC-208ENST00000472420 694 ntTSL 27.09□□□□□ -1.278e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PRMT5-220ENST00000556032 643 ntTSL 56.68□□□□□ -1.341e-7■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LRPPRC-209ENST00000483489 564 ntTSL 25.93□□□□□ -1.468e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.538e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 CSE1L-203ENST00000469700 1401 ntTSL 1 (best)5.25□□□□□ -1.574e-14■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 55□□□□□ -1.618e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 24.58□□□□□ -1.688e-10■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 CTDSP1-211ENST00000492545 634 ntTSL 522.14■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 49.93□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-205ENST00000424913 592 ntTSL 47.63□□□□□ -1.191e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-211ENST00000437738 565 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 56.72□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 56.29□□□□□ -1.41e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 45.49□□□□□ -1.531e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.111e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.388e-9■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 ADCY9-207ENST00000576936 697 ntTSL 512.2□□□□□ -0.468e-9■■■■□ 22.3
PCBP2Q15366 ARRB1-211ENST00000533255 551 ntTSL 210.91□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.394e-8■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.162e-8■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.828e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.238e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TBL1XR1-225ENST00000636187 171 ntTSL 517.21■□□□□ 0.354e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LY6G5B-208ENST00000409525 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.612e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.342e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FBXO31-202ENST00000561664 305 ntTSL 512.95□□□□□ -0.343e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.717e-14■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KDM2A-207ENST00000526258 5671 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.417e-14■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.477e-14■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 KDM2A-204ENST00000524657 3692 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.927e-14■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-205ENST00000525774 588 ntTSL 422.63■■□□□ 1.213e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-206ENST00000527156 922 ntTSL 210.42□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-207ENST00000532201 597 ntTSL 410.08□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 LRRC8D-203ENST00000414841 666 ntTSL 37.43□□□□□ -1.223e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.742e-8■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TBL1XR1-232ENST00000637544 214 ntTSL 52.35□□□□□ -2.035e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.235e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 TLN1-202ENST00000378192 1693 ntTSL 211.51□□□□□ -0.579e-7■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.33e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 521.15■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 22.2
PCBP2Q15366 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.913e-6■■■■□ 22.2
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