RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627278.1

PRMT5-228, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRMT5, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT5-228ENST00000627278 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.93■■■■■ 6.86
PRMT5-228ENST00000627278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.67■■■■■ 5.86
PRMT5-228ENST00000627278 ABCC9O60706 1549 aa51.18■■■■■ 5.78
PRMT5-228ENST00000627278 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.9■■■■■ 5.42
PRMT5-228ENST00000627278 NACADO15069 1562 aa48.73■■■■■ 5.39
PRMT5-228ENST00000627278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.61■■■■■ 5.37
PRMT5-228ENST00000627278 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.27■■■■■ 5.32
PRMT5-228ENST00000627278 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
PRMT5-228ENST00000627278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.96■■■■■ 5.27
PRMT5-228ENST00000627278 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.86■■■■■ 5.25
PRMT5-228ENST00000627278 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.79■■■■■ 5.24
PRMT5-228ENST00000627278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.71■■■■■ 5.23
PRMT5-228ENST00000627278 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.61■■■■■ 5.21
PRMT5-228ENST00000627278 SCRIBQ14160 1630 aa47.12■■■■■ 5.13
PRMT5-228ENST00000627278 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.82■■■■■ 5.09
PRMT5-228ENST00000627278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
PRMT5-228ENST00000627278 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.28■■■■■ 5
PRMT5-228ENST00000627278 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.02■■■■■ 4.96
PRMT5-228ENST00000627278 SMARCA4P51532 1647 aa45.04■■■■■ 4.8
PRMT5-228ENST00000627278 NCAPD3P42695 1498 aa45.04■■■■■ 4.8
PRMT5-228ENST00000627278 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.98■■■■■ 4.79
PRMT5-228ENST00000627278 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
PRMT5-228ENST00000627278 SMARCA2P51531 1590 aa44.8■■■■■ 4.76
PRMT5-228ENST00000627278 HMGXB3Q12766 1538 aa44.69■■■■■ 4.74
PRMT5-228ENST00000627278 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.68■■■■■ 4.74
PRMT5-228ENST00000627278 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.63■■■■■ 4.73
PRMT5-228ENST00000627278 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
PRMT5-228ENST00000627278 NESP48681 1621 aa44.18■■■■■ 4.66
PRMT5-228ENST00000627278 WIZO95785 1651 aa44.16■■■■■ 4.66
PRMT5-228ENST00000627278 ERCC6Q03468 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
PRMT5-228ENST00000627278 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
PRMT5-228ENST00000627278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.87■■■■■ 4.61
PRMT5-228ENST00000627278 CUX2O14529 1486 aa43.82■■■■■ 4.6
PRMT5-228ENST00000627278 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
PRMT5-228ENST00000627278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.6■■■■■ 4.57
PRMT5-228ENST00000627278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.57■■■■■ 4.57
PRMT5-228ENST00000627278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
PRMT5-228ENST00000627278 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
PRMT5-228ENST00000627278 CFTRP13569 1480 aa43.31■■■■■ 4.52
PRMT5-228ENST00000627278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.3■■■■■ 4.52
PRMT5-228ENST00000627278 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.18■■■■■ 4.5
PRMT5-228ENST00000627278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.15■■■■■ 4.5
PRMT5-228ENST00000627278 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.14■■■■■ 4.5
PRMT5-228ENST00000627278 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.1■■■■■ 4.49
PRMT5-228ENST00000627278 WDR62O43379 1518 aa43.08■■■■■ 4.49
PRMT5-228ENST00000627278 PRDM2Q13029 1718 aa42.89■■■■■ 4.46
PRMT5-228ENST00000627278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
PRMT5-228ENST00000627278 TOPBP1Q92547 1522 aa42.42■■■■■ 4.38
PRMT5-228ENST00000627278 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PRMT5-228ENST00000627278 ABCC8Q09428 1581 aa42.3■■■■■ 4.36
PRMT5-228ENST00000627278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.27■■■■■ 4.36
PRMT5-228ENST00000627278 IFT140Q96RY7 1462 aa42.23■■■■■ 4.35
PRMT5-228ENST00000627278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
PRMT5-228ENST00000627278 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
PRMT5-228ENST00000627278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
PRMT5-228ENST00000627278 OSCARQ8IYS5 282 aa41.97■■■■■ 4.31
PRMT5-228ENST00000627278 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
PRMT5-228ENST00000627278 CUX1P39880 1505 aa41.92■■■■■ 4.3
PRMT5-228ENST00000627278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.9■■■■■ 4.3
PRMT5-228ENST00000627278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.35e-6■■■□□ 17
PRMT5-228ENST00000627278 SOGA1O94964 1423 aa41.84■■■■■ 4.29
PRMT5-228ENST00000627278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.82■■■■■ 4.29
PRMT5-228ENST00000627278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
PRMT5-228ENST00000627278 CHD1O14646 1710 aa41.55■■■■■ 4.24
PRMT5-228ENST00000627278 TRIM41Q8WV44 630 aa41.53■■■■■ 4.24
PRMT5-228ENST00000627278 WDR97A6NE52 1622 aa41.53■■■■■ 4.24
PRMT5-228ENST00000627278 FBLN2P98095 1184 aa41.41■■■■■ 4.22
PRMT5-228ENST00000627278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
PRMT5-228ENST00000627278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.39■■■■■ 4.22
PRMT5-228ENST00000627278 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.37■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.37■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.37■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 GRIN2BQ13224 1484 aa41.37■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 TOP2BQ02880 1626 aa41.36■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.36■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 SYNJ1O43426 1573 aa41.36■■■■■ 4.21
PRMT5-228ENST00000627278 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.32■■■■■ 4.2
PRMT5-228ENST00000627278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
PRMT5-228ENST00000627278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.28■■■■■ 4.2
PRMT5-228ENST00000627278 ARHGEF11O15085 1522 aa41.28■■■■■ 4.2
PRMT5-228ENST00000627278 PBRM1Q86U86 1689 aa41.27■■■■■ 4.2
PRMT5-228ENST00000627278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
PRMT5-228ENST00000627278 SYNJ2O15056 1496 aa41.17■■■■■ 4.18
PRMT5-228ENST00000627278 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.09■■■■■ 4.17
PRMT5-228ENST00000627278 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.98■■■■■ 4.15
PRMT5-228ENST00000627278 ARAP1Q96P48 1450 aa40.94■■■■■ 4.14
PRMT5-228ENST00000627278 ADAMTS12P58397 1594 aa40.89■■■■■ 4.14
PRMT5-228ENST00000627278 GRIN2AQ12879 1464 aa40.85■■■■■ 4.13
PRMT5-228ENST00000627278 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.85■■■■■ 4.13
PRMT5-228ENST00000627278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.81■■■■■ 4.12
PRMT5-228ENST00000627278 NUP160Q12769 1436 aa40.73■■■■■ 4.11
PRMT5-228ENST00000627278 CEP170Q5SW79 1584 aa40.72■■■■■ 4.11
PRMT5-228ENST00000627278 IGF1RP08069 1367 aa40.57■■■■■ 4.08
PRMT5-228ENST00000627278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.56■■■■■ 4.08
PRMT5-228ENST00000627278 KIF27Q86VH2 1401 aa40.51■■■■■ 4.08
PRMT5-228ENST00000627278 SHROOM2Q13796 1616 aa40.5■■■■■ 4.07
PRMT5-228ENST00000627278 JPH4Q96JJ6 628 aa40.35■■■■■ 4.05
PRMT5-228ENST00000627278 CUL7Q14999 1698 aa40.33■■■■■ 4.05
PRMT5-228ENST00000627278 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.3■■■■■ 4.04
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