RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.2■■■■■ 6.91
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.91■■■■■ 5.9
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC9O60706 1549 aa51.31■■■■■ 5.8
CTDSP1-211ENST00000492545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.18■■■■■ 5.46
CTDSP1-211ENST00000492545 NACADO15069 1562 aa49.03■■■■■ 5.44
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.9■■■■■ 5.42
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.63■■■■■ 5.38
CTDSP1-211ENST00000492545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
CTDSP1-211ENST00000492545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.19■■■■■ 5.31
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CTDSP1-211ENST00000492545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.84■■■■■ 5.25
CTDSP1-211ENST00000492545 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.62■■■■■ 5.21
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.61■■■■■ 5.21
CTDSP1-211ENST00000492545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.26■■■■■ 5.16
CTDSP1-211ENST00000492545 SCRIBQ14160 1630 aa47.25■■■■■ 5.15
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
CTDSP1-211ENST00000492545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.37■■■■■ 5.01
CTDSP1-211ENST00000492545 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.22■■■■■ 4.99
CTDSP1-211ENST00000492545 NCAPD3P42695 1498 aa45.29■■■■■ 4.84
CTDSP1-211ENST00000492545 SMARCA4P51532 1647 aa45.2■■■■■ 4.83
CTDSP1-211ENST00000492545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.18■■■■■ 4.82
CTDSP1-211ENST00000492545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.16■■■■■ 4.82
CTDSP1-211ENST00000492545 SMARCA2P51531 1590 aa45.11■■■■■ 4.81
CTDSP1-211ENST00000492545 HMGXB3Q12766 1538 aa44.94■■■■■ 4.78
CTDSP1-211ENST00000492545 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.84■■■■■ 4.77
CTDSP1-211ENST00000492545 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.78■■■■■ 4.76
CTDSP1-211ENST00000492545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
CTDSP1-211ENST00000492545 ERCC6Q03468 1493 aa44.33■■■■■ 4.69
CTDSP1-211ENST00000492545 WIZO95785 1651 aa44.21■■■■■ 4.67
CTDSP1-211ENST00000492545 NESP48681 1621 aa44.21■■■■■ 4.67
CTDSP1-211ENST00000492545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
CTDSP1-211ENST00000492545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.11■■■■■ 4.65
CTDSP1-211ENST00000492545 CUX2O14529 1486 aa44.08■■■■■ 4.65
CTDSP1-211ENST00000492545 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.95■■■■■ 4.63
CTDSP1-211ENST00000492545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.92■■■■■ 4.62
CTDSP1-211ENST00000492545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.79■■■■■ 4.6
CTDSP1-211ENST00000492545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.57
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.59■■■■■ 4.57
CTDSP1-211ENST00000492545 CFTRP13569 1480 aa43.54■■■■■ 4.56
CTDSP1-211ENST00000492545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
CTDSP1-211ENST00000492545 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.42■■■■■ 4.54
CTDSP1-211ENST00000492545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.38■■■■■ 4.53
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.37■■■■■ 4.53
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.31■■■■■ 4.52
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR62O43379 1518 aa43.26■■■■■ 4.52
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDM2Q13029 1718 aa42.97■■■■■ 4.47
CTDSP1-211ENST00000492545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCC8Q09428 1581 aa42.69■■■■■ 4.43
CTDSP1-211ENST00000492545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.41
CTDSP1-211ENST00000492545 TOPBP1Q92547 1522 aa42.6■■■■■ 4.41
CTDSP1-211ENST00000492545 IFT140Q96RY7 1462 aa42.52■■■■■ 4.4
CTDSP1-211ENST00000492545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.49■■■■■ 4.39
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CTDSP1-211ENST00000492545 OSCARQ8IYS5 282 aa42.26■■■■■ 4.36
CTDSP1-211ENST00000492545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
CTDSP1-211ENST00000492545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
CTDSP1-211ENST00000492545 SOGA1O94964 1423 aa42.09■■■■■ 4.33
CTDSP1-211ENST00000492545 CUX1P39880 1505 aa42.05■■■■■ 4.32
CTDSP1-211ENST00000492545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
CTDSP1-211ENST00000492545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.32
CTDSP1-211ENST00000492545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.01■■■■■ 4.32
CTDSP1-211ENST00000492545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.99■■■■■ 4.31
CTDSP1-211ENST00000492545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.88■■■■■ 4.3
CTDSP1-211ENST00000492545 WDR97A6NE52 1622 aa41.86■■■■■ 4.29
CTDSP1-211ENST00000492545 FBLN2P98095 1184 aa41.68■■■■■ 4.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM41Q8WV44 630 aa41.66■■■■■ 4.26
CTDSP1-211ENST00000492545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIN2BQ13224 1484 aa41.65■■■■■ 4.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.63■■■■■ 4.25
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
CTDSP1-211ENST00000492545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.59■■■■■ 4.25
CTDSP1-211ENST00000492545 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.57■■■■■ 4.25
CTDSP1-211ENST00000492545 TOP2BQ02880 1626 aa41.56■■■■■ 4.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CHD1O14646 1710 aa41.55■■■■■ 4.24
CTDSP1-211ENST00000492545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CTDSP1-211ENST00000492545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.51■■■■■ 4.24
CTDSP1-211ENST00000492545 SYNJ1O43426 1573 aa41.46■■■■■ 4.23
CTDSP1-211ENST00000492545 SYNJ2O15056 1496 aa41.43■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 ARHGEF11O15085 1522 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDSP1-211ENST00000492545 PBRM1Q86U86 1689 aa41.34■■■■■ 4.21
CTDSP1-211ENST00000492545 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.2■■■■■ 4.19
CTDSP1-211ENST00000492545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.15■■■■■ 4.18
CTDSP1-211ENST00000492545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.13■■■■■ 4.17
CTDSP1-211ENST00000492545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.1■■■■■ 4.17
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIN2AQ12879 1464 aa41.07■■■■■ 4.16
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAMTS12P58397 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
CTDSP1-211ENST00000492545 ARAP1Q96P48 1450 aa41.02■■■■■ 4.16
CTDSP1-211ENST00000492545 NUP160Q12769 1436 aa40.94■■■■■ 4.14
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF27Q86VH2 1401 aa40.88■■■■■ 4.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP170Q5SW79 1584 aa40.81■■■■■ 4.12
CTDSP1-211ENST00000492545 IGF1RP08069 1367 aa40.78■■■■■ 4.12
CTDSP1-211ENST00000492545 SHROOM2Q13796 1616 aa40.61■■■■■ 4.09
CTDSP1-211ENST00000492545 JPH4Q96JJ6 628 aa40.6■■■■■ 4.09
CTDSP1-211ENST00000492545 CUL7Q14999 1698 aa40.58■■■■■ 4.09
CTDSP1-211ENST00000492545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.52■■■■■ 4.08
CTDSP1-211ENST00000492545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.52■■■■■ 4.08
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