RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC9O60706 1549 aa18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4-208ENST00000462602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.29■□□□□ 0.52
SH3BP4-208ENST00000462602 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.23■□□□□ 0.51
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.18■□□□□ 0.5
SH3BP4-208ENST00000462602 NACADO15069 1562 aa18.15■□□□□ 0.5
SH3BP4-208ENST00000462602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-208ENST00000462602 SCRIBQ14160 1630 aa17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4-208ENST00000462602 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.56■□□□□ 0.4
SH3BP4-208ENST00000462602 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-208ENST00000462602 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-208ENST00000462602 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.07■□□□□ 0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCA4P51532 1647 aa16.96■□□□□ 0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SMARCA2P51531 1590 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-208ENST00000462602 NCAPD3P42695 1498 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 WIZO95785 1651 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-208ENST00000462602 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 HMGXB3Q12766 1538 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-208ENST00000462602 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-208ENST00000462602 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CFTRP13569 1480 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-208ENST00000462602 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-208ENST00000462602 NESP48681 1621 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 PDS5BQ9NTI5 1447 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDM2Q13029 1718 aa16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ERCC6Q03468 1493 aa16.04■□□□□ 0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.03■□□□□ 0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC8Q09428 1581 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.89■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM41Q8WV44 630 aa15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TOPBP1Q92547 1522 aa15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DNMBPQ6XZF7 1577 aa15.87■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CUX1P39880 1505 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR62O43379 1518 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TOP2BQ02880 1626 aa15.83■□□□□ 0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNJ1O43426 1573 aa15.82■□□□□ 0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.81■□□□□ 0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.77■□□□□ 0.11
SH3BP4-208ENST00000462602 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SH3BP4-208ENST00000462602 CUX2O14529 1486 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-208ENST00000462602 SOGA1O94964 1423 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT140Q96RY7 1462 aa15.71■□□□□ 0.1
SH3BP4-208ENST00000462602 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.67■□□□□ 0.1
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa15.65■□□□□ 0.1
SH3BP4-208ENST00000462602 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF27Q86VH2 1401 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP4-208ENST00000462602 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP4-208ENST00000462602 EEA1Q15075 1411 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR97A6NE52 1622 aa15.57■□□□□ 0.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP4-208ENST00000462602 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.083e-7■■■□□ 16
SH3BP4-208ENST00000462602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.51■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIN2BQ13224 1484 aa15.5■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 IGF1RP08069 1367 aa15.49■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4-208ENST00000462602 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4-208ENST00000462602 PBRM1Q86U86 1689 aa15.41■□□□□ 0.06
SH3BP4-208ENST00000462602 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.4■□□□□ 0.06
SH3BP4-208ENST00000462602 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CUL7Q14999 1698 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 PRXQ9BXM0 1461 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNJ2O15056 1496 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAMTS12P58397 1594 aa15.34■□□□□ 0.05
SH3BP4-208ENST00000462602 FBLN2P98095 1184 aa15.33■□□□□ 0.04
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF21BO75037 1637 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA3Q08378 1498 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP4-208ENST00000462602 GRIN2AQ12879 1464 aa15.27■□□□□ 0.04
SH3BP4-208ENST00000462602 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SH3BP4-208ENST00000462602 EHMT2Q96KQ7 1210 aa15.25■□□□□ 0.03
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP4-208ENST00000462602 NUP160Q12769 1436 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OSCARQ8IYS5 282 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CHD1O14646 1710 aa15.2■□□□□ 0.02
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