Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD3Q9NPG1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD3Q9NPG1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FZD3Q9NPG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FZD3Q9NPG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms