Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FZD3Q9NPG1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FZD3Q9NPG1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FZD3Q9NPG1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FZD3Q9NPG1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FZD3Q9NPG1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FZD3Q9NPG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
FZD3Q9NPG1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
FZD3Q9NPG1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
FZD3Q9NPG1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FZD3Q9NPG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FZD3Q9NPG1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FZD3Q9NPG1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FZD3Q9NPG1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FZD3Q9NPG1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FZD3Q9NPG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FZD3Q9NPG1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FZD3Q9NPG1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
FZD3Q9NPG1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FZD3Q9NPG1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FZD3Q9NPG1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FZD3Q9NPG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FZD3Q9NPG1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FZD3Q9NPG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FZD3Q9NPG1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FZD3Q9NPG1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FZD3Q9NPG1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FZD3Q9NPG1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FZD3Q9NPG1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FZD3Q9NPG1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FZD3Q9NPG1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FZD3Q9NPG1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FZD3Q9NPG1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FZD3Q9NPG1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FZD3Q9NPG1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FZD3Q9NPG1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FZD3Q9NPG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FZD3Q9NPG1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FZD3Q9NPG1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FZD3Q9NPG1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FZD3Q9NPG1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FZD3Q9NPG1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FZD3Q9NPG1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FZD3Q9NPG1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FZD3Q9NPG1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FZD3Q9NPG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FZD3Q9NPG1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
FZD3Q9NPG1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FZD3Q9NPG1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
FZD3Q9NPG1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FZD3Q9NPG1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FZD3Q9NPG1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FZD3Q9NPG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FZD3Q9NPG1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FZD3Q9NPG1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FZD3Q9NPG1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FZD3Q9NPG1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD3Q9NPG1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FZD3Q9NPG1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FZD3Q9NPG1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FZD3Q9NPG1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD3Q9NPG1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FZD3Q9NPG1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FZD3Q9NPG1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FZD3Q9NPG1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FZD3Q9NPG1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FZD3Q9NPG1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FZD3Q9NPG1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FZD3Q9NPG1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FZD3Q9NPG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FZD3Q9NPG1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FZD3Q9NPG1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FZD3Q9NPG1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD3Q9NPG1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FZD3Q9NPG1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FZD3Q9NPG1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD3Q9NPG1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FZD3Q9NPG1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FZD3Q9NPG1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FZD3Q9NPG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD3Q9NPG1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FZD3Q9NPG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FZD3Q9NPG1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FZD3Q9NPG1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FZD3Q9NPG1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
FZD3Q9NPG1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FZD3Q9NPG1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FZD3Q9NPG1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms