Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VOPP1Q96AW1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VOPP1Q96AW1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms