Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EEF1DP3Q658K8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EEF1DP3Q658K8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms