Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNAP25P60880 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNAP25P60880 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAP25P60880 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAP25P60880 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms