Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNIP3LO60238 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNIP3LO60238 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNIP3LO60238 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNIP3LO60238 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms