Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
BNIP3LO60238 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
BNIP3LO60238 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
BNIP3LO60238 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BNIP3LO60238 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BNIP3LO60238 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
BNIP3LO60238 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BNIP3LO60238 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BNIP3LO60238 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BNIP3LO60238 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
BNIP3LO60238 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BNIP3LO60238 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BNIP3LO60238 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
BNIP3LO60238 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
BNIP3LO60238 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BNIP3LO60238 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
BNIP3LO60238 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BNIP3LO60238 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BNIP3LO60238 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BNIP3LO60238 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BNIP3LO60238 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BNIP3LO60238 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
BNIP3LO60238 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BNIP3LO60238 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BNIP3LO60238 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BNIP3LO60238 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BNIP3LO60238 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BNIP3LO60238 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
BNIP3LO60238 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BNIP3LO60238 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
BNIP3LO60238 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BNIP3LO60238 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BNIP3LO60238 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BNIP3LO60238 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BNIP3LO60238 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
BNIP3LO60238 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
BNIP3LO60238 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BNIP3LO60238 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BNIP3LO60238 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
BNIP3LO60238 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BNIP3LO60238 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
BNIP3LO60238 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BNIP3LO60238 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BNIP3LO60238 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BNIP3LO60238 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
BNIP3LO60238 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BNIP3LO60238 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
BNIP3LO60238 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BNIP3LO60238 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
BNIP3LO60238 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
BNIP3LO60238 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
BNIP3LO60238 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
BNIP3LO60238 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
BNIP3LO60238 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
BNIP3LO60238 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
BNIP3LO60238 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BNIP3LO60238 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BNIP3LO60238 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BNIP3LO60238 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BNIP3LO60238 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BNIP3LO60238 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
BNIP3LO60238 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
BNIP3LO60238 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
BNIP3LO60238 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BNIP3LO60238 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BNIP3LO60238 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BNIP3LO60238 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BNIP3LO60238 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BNIP3LO60238 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BNIP3LO60238 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BNIP3LO60238 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BNIP3LO60238 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BNIP3LO60238 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BNIP3LO60238 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BNIP3LO60238 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BNIP3LO60238 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BNIP3LO60238 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BNIP3LO60238 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BNIP3LO60238 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BNIP3LO60238 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BNIP3LO60238 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BNIP3LO60238 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BNIP3LO60238 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BNIP3LO60238 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BNIP3LO60238 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BNIP3LO60238 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BNIP3LO60238 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BNIP3LO60238 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BNIP3LO60238 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BNIP3LO60238 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BNIP3LO60238 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BNIP3LO60238 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms