Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC16AO15027 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC16AO15027 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC16AO15027 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms