Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1C5

CYP2D7, Putative cytochrome P450 2D7, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2D7A0A087X1C5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP2D7A0A087X1C5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP2D7A0A087X1C5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP2D7A0A087X1C5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2D7A0A087X1C5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms