Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A1P53007 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC25A1P53007 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms