RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.87■■■□□ 2.69
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.57■■■□□ 2.48
TRPC1-201ENST00000273482 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.22■■■□□ 2.27
TRPC1-201ENST00000273482 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TRPC1-201ENST00000273482 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.63■■■□□ 2.01
TRPC1-201ENST00000273482 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.46■■□□□ 1.99
TRPC1-201ENST00000273482 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC9O60706 1549 aa27.19■■□□□ 1.94
TRPC1-201ENST00000273482 HRCP23327 699 aa26.97■■□□□ 1.91
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM41Q8WV44 630 aa26.86■■□□□ 1.89
TRPC1-201ENST00000273482 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
TRPC1-201ENST00000273482 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
TRPC1-201ENST00000273482 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TRPC1-201ENST00000273482 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
TRPC1-201ENST00000273482 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
TRPC1-201ENST00000273482 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
TRPC1-201ENST00000273482 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TRPC1-201ENST00000273482 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.48■■□□□ 1.83
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.42■■□□□ 1.82
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
TRPC1-201ENST00000273482 APLP2Q06481 763 aa26.28■■□□□ 1.8
TRPC1-201ENST00000273482 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.26■■□□□ 1.79
TRPC1-201ENST00000273482 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TRPC1-201ENST00000273482 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
TRPC1-201ENST00000273482 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
TRPC1-201ENST00000273482 SCRIBQ14160 1630 aa26.09■■□□□ 1.77
TRPC1-201ENST00000273482 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TRPC1-201ENST00000273482 MYT1Q01538 1121 aa25.86■■□□□ 1.73
TRPC1-201ENST00000273482 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TRPC1-201ENST00000273482 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.47■■□□□ 1.67
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TRPC1-201ENST00000273482 NACADO15069 1562 aa25.41■■□□□ 1.66
TRPC1-201ENST00000273482 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TRPC1-201ENST00000273482 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TRPC1-201ENST00000273482 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.33■■□□□ 1.65
TRPC1-201ENST00000273482 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.27■■□□□ 1.64
TRPC1-201ENST00000273482 ITGAEP38570 1179 aa25.25■■□□□ 1.63
TRPC1-201ENST00000273482 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.24■■□□□ 1.63
TRPC1-201ENST00000273482 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.2■■□□□ 1.62
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRPC1-201ENST00000273482 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRPC1-201ENST00000273482 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.13■■□□□ 1.61
TRPC1-201ENST00000273482 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRPC1-201ENST00000273482 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.98■■□□□ 1.59
TRPC1-201ENST00000273482 NEFLP07196 543 aa24.95■■□□□ 1.58
TRPC1-201ENST00000273482 P3H3Q8IVL6 736 aa24.87■■□□□ 1.57
TRPC1-201ENST00000273482 FBLN2P98095 1184 aa24.86■■□□□ 1.57
TRPC1-201ENST00000273482 NEUROD1Q13562 356 aa24.85■■□□□ 1.57
TRPC1-201ENST00000273482 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.82■■□□□ 1.56
TRPC1-201ENST00000273482 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TRPC1-201ENST00000273482 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRPC1-201ENST00000273482 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRPC1-201ENST00000273482 ARID3CA6NKF2 412 aa24.66■■□□□ 1.54
TRPC1-201ENST00000273482 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
TRPC1-201ENST00000273482 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.55■■□□□ 1.52
TRPC1-201ENST00000273482 WIZO95785 1651 aa24.47■■□□□ 1.51
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.46■■□□□ 1.51
TRPC1-201ENST00000273482 BCANQ96GW7 911 aa24.41■■□□□ 1.5
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC8Q09428 1581 aa24.3■■□□□ 1.48
TRPC1-201ENST00000273482 SOGA1O94964 1423 aa24.3■■□□□ 1.48
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM52Q96A61 297 aa24.3■■□□□ 1.48
TRPC1-201ENST00000273482 CLIP1P30622 1438 aa24.27■■□□□ 1.48
TRPC1-201ENST00000273482 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.26■■□□□ 1.47
TRPC1-201ENST00000273482 MIER1Q8N108 512 aa24.26■■□□□ 1.47
TRPC1-201ENST00000273482 CEP162Q5TB80 1403 aa24.23■■□□□ 1.47
TRPC1-201ENST00000273482 EEA1Q15075 1411 aa24.21■■□□□ 1.47
TRPC1-201ENST00000273482 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
TRPC1-201ENST00000273482 SMARCA2P51531 1590 aa24.17■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA3Q08378 1498 aa24.17■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 SMARCA4P51532 1647 aa24.16■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
TRPC1-201ENST00000273482 KIF27Q86VH2 1401 aa24.14■■□□□ 1.45
TRPC1-201ENST00000273482 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.11■■□□□ 1.45
TRPC1-201ENST00000273482 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRPC1-201ENST00000273482 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.07■■□□□ 1.44
TRPC1-201ENST00000273482 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.03■■□□□ 1.44
TRPC1-201ENST00000273482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TRPC1-201ENST00000273482 ANP32CO43423 234 aa23.98■■□□□ 1.43
TRPC1-201ENST00000273482 CUX2O14529 1486 aa23.98■■□□□ 1.43
TRPC1-201ENST00000273482 FKBP8Q14318 412 aa23.96■■□□□ 1.43
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
TRPC1-201ENST00000273482 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.95■■□□□ 1.42
TRPC1-201ENST00000273482 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.9■■□□□ 1.42
TRPC1-201ENST00000273482 ERCC6Q03468 1493 aa23.89■■□□□ 1.42
TRPC1-201ENST00000273482 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.89■■□□□ 1.42
TRPC1-201ENST00000273482 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.88■■□□□ 1.41
TRPC1-201ENST00000273482 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
TRPC1-201ENST00000273482 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.84■■□□□ 1.41
TRPC1-201ENST00000273482 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
TRPC1-201ENST00000273482 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TRPC1-201ENST00000273482 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
TRPC1-201ENST00000273482 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TRPC1-201ENST00000273482 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.68■■□□□ 1.38
TRPC1-201ENST00000273482 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.67■■□□□ 1.38
TRPC1-201ENST00000273482 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
TRPC1-201ENST00000273482 KCNH8Q96L42 1107 aa23.64■■□□□ 1.37
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