RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312492.2

HOXC5-201, Transcript of homeobox C5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC5, Length 1,805 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5-201ENST00000312492 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.21■■■■□ 3.71
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HOXC5-201ENST00000312492 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
HOXC5-201ENST00000312492 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.59■■■□□ 2.65
HOXC5-201ENST00000312492 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXC5-201ENST00000312492 ABCC9O60706 1549 aa31.34■■■□□ 2.61
HOXC5-201ENST00000312492 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.27■■■□□ 2.6
HOXC5-201ENST00000312492 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.16■■■□□ 2.58
HOXC5-201ENST00000312492 NACADO15069 1562 aa30.96■■■□□ 2.55
HOXC5-201ENST00000312492 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.69■■■□□ 2.5
HOXC5-201ENST00000312492 SCRIBQ14160 1630 aa30.65■■■□□ 2.5
HOXC5-201ENST00000312492 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
HOXC5-201ENST00000312492 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.12■■■□□ 2.41
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HOXC5-201ENST00000312492 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
HOXC5-201ENST00000312492 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXC5-201ENST00000312492 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
HOXC5-201ENST00000312492 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.52■■■□□ 2.32
HOXC5-201ENST00000312492 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
HOXC5-201ENST00000312492 SMARCA4P51532 1647 aa29.38■■■□□ 2.29
HOXC5-201ENST00000312492 WIZO95785 1651 aa29.33■■■□□ 2.29
HOXC5-201ENST00000312492 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXC5-201ENST00000312492 PEG3Q9GZU2 1588 aa29■■■□□ 2.23
HOXC5-201ENST00000312492 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXC5-201ENST00000312492 SMARCA2P51531 1590 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXC5-201ENST00000312492 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
HOXC5-201ENST00000312492 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXC5-201ENST00000312492 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
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HOXC5-201ENST00000312492 NCAPD3P42695 1498 aa28.53■■■□□ 2.16
HOXC5-201ENST00000312492 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.39■■■□□ 2.14
HOXC5-201ENST00000312492 TRIM41Q8WV44 630 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXC5-201ENST00000312492 ABCC8Q09428 1581 aa28.17■■■□□ 2.1
HOXC5-201ENST00000312492 CFTRP13569 1480 aa27.95■■■□□ 2.07
HOXC5-201ENST00000312492 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.07
HOXC5-201ENST00000312492 PRDM2Q13029 1718 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXC5-201ENST00000312492 SYNJ1O43426 1573 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXC5-201ENST00000312492 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXC5-201ENST00000312492 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXC5-201ENST00000312492 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXC5-201ENST00000312492 TOP2BQ02880 1626 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXC5-201ENST00000312492 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXC5-201ENST00000312492 EEA1Q15075 1411 aa27.64■■■□□ 2.01
HOXC5-201ENST00000312492 SOGA1O94964 1423 aa27.63■■■□□ 2.01
HOXC5-201ENST00000312492 CUX1P39880 1505 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXC5-201ENST00000312492 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.6■■■□□ 2.01
HOXC5-201ENST00000312492 NESP48681 1621 aa27.54■■■□□ 2
HOXC5-201ENST00000312492 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.54■■■□□ 2
HOXC5-201ENST00000312492 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.52■■■□□ 2
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HOXC5-201ENST00000312492 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXC5-201ENST00000312492 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.43■■□□□ 1.98
HOXC5-201ENST00000312492 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.37■■□□□ 1.97
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HOXC5-201ENST00000312492 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC5-201ENST00000312492 KIF21BO75037 1637 aa27.3■■□□□ 1.96
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HOXC5-201ENST00000312492 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.29■■□□□ 1.96
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HOXC5-201ENST00000312492 KIF27Q86VH2 1401 aa27.24■■□□□ 1.95
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HOXC5-201ENST00000312492 CUX2O14529 1486 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXC5-201ENST00000312492 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
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HOXC5-201ENST00000312492 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC5-201ENST00000312492 PRXQ9BXM0 1461 aa27.07■■□□□ 1.92
HOXC5-201ENST00000312492 CEP162Q5TB80 1403 aa27.06■■□□□ 1.92
HOXC5-201ENST00000312492 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.04■■□□□ 1.92
HOXC5-201ENST00000312492 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.04■■□□□ 1.92
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HOXC5-201ENST00000312492 WDR97A6NE52 1622 aa27■■□□□ 1.91
HOXC5-201ENST00000312492 IGF1RP08069 1367 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXC5-201ENST00000312492 ERCC6Q03468 1493 aa26.89■■□□□ 1.89
HOXC5-201ENST00000312492 WDR62O43379 1518 aa26.87■■□□□ 1.89
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HOXC5-201ENST00000312492 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.85■■□□□ 1.89
HOXC5-201ENST00000312492 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.83■■□□□ 1.88
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HOXC5-201ENST00000312492 IFT140Q96RY7 1462 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXC5-201ENST00000312492 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC5-201ENST00000312492 PBRM1Q86U86 1689 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC5-201ENST00000312492 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXC5-201ENST00000312492 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXC5-201ENST00000312492 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC5-201ENST00000312492 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXC5-201ENST00000312492 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
HOXC5-201ENST00000312492 ARAP1Q96P48 1450 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXC5-201ENST00000312492 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
HOXC5-201ENST00000312492 GRIN2BQ13224 1484 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXC5-201ENST00000312492 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC5-201ENST00000312492 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXC5-201ENST00000312492 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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