RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331444.10

DGCR6-201, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DGCR6, Length 1,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-201ENST00000331444 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.07■■■■■ 5.29
DGCR6-201ENST00000331444 ABCC9O60706 1549 aa43.46■■■■■ 4.55
DGCR6-201ENST00000331444 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.35■■■■■ 4.53
DGCR6-201ENST00000331444 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.33■■■■■ 4.21
DGCR6-201ENST00000331444 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.1■■■■■ 4.17
DGCR6-201ENST00000331444 NACADO15069 1562 aa41■■■■■ 4.15
DGCR6-201ENST00000331444 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.54■■■■■ 4.08
DGCR6-201ENST00000331444 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.42■■■■■ 4.06
DGCR6-201ENST00000331444 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.4■■■■■ 4.06
DGCR6-201ENST00000331444 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
DGCR6-201ENST00000331444 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.22■■■■■ 4.03
DGCR6-201ENST00000331444 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
DGCR6-201ENST00000331444 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.77■■■■□ 3.96
DGCR6-201ENST00000331444 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.64■■■■□ 3.94
DGCR6-201ENST00000331444 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.34■■■■□ 3.89
DGCR6-201ENST00000331444 SCRIBQ14160 1630 aa39.33■■■■□ 3.89
DGCR6-201ENST00000331444 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.21■■■■□ 3.87
DGCR6-201ENST00000331444 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
DGCR6-201ENST00000331444 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.96■■■■□ 3.67
DGCR6-201ENST00000331444 NCAPD3P42695 1498 aa37.85■■■■□ 3.65
DGCR6-201ENST00000331444 CUX2O14529 1486 aa37.67■■■■□ 3.62
DGCR6-201ENST00000331444 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.66■■■■□ 3.62
DGCR6-201ENST00000331444 SMARCA4P51532 1647 aa37.58■■■■□ 3.61
DGCR6-201ENST00000331444 HMGXB3Q12766 1538 aa37.56■■■■□ 3.6
DGCR6-201ENST00000331444 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
DGCR6-201ENST00000331444 ERCC6Q03468 1493 aa37.5■■■■□ 3.59
DGCR6-201ENST00000331444 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
DGCR6-201ENST00000331444 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.29■■■■□ 3.56
DGCR6-201ENST00000331444 NESP48681 1621 aa37.29■■■■□ 3.56
DGCR6-201ENST00000331444 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
DGCR6-201ENST00000331444 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
DGCR6-201ENST00000331444 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.05■■■■□ 3.52
DGCR6-201ENST00000331444 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.02■■■■□ 3.52
DGCR6-201ENST00000331444 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.88■■■■□ 3.49
DGCR6-201ENST00000331444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.76■■■■□ 3.47
DGCR6-201ENST00000331444 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.63■■■■□ 3.45
DGCR6-201ENST00000331444 WIZO95785 1651 aa36.57■■■■□ 3.44
DGCR6-201ENST00000331444 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.49■■■■□ 3.43
DGCR6-201ENST00000331444 WDR62O43379 1518 aa36.47■■■■□ 3.43
DGCR6-201ENST00000331444 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.25■■■■□ 3.39
DGCR6-201ENST00000331444 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.2■■■■□ 3.39
DGCR6-201ENST00000331444 CFTRP13569 1480 aa36.19■■■■□ 3.38
DGCR6-201ENST00000331444 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
DGCR6-201ENST00000331444 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
DGCR6-201ENST00000331444 TRIM41Q8WV44 630 aa35.99■■■■□ 3.35
DGCR6-201ENST00000331444 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
DGCR6-201ENST00000331444 PRDM2Q13029 1718 aa35.92■■■■□ 3.34
DGCR6-201ENST00000331444 OSCARQ8IYS5 282 aa35.79■■■■□ 3.32
DGCR6-201ENST00000331444 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.65■■■■□ 3.3
DGCR6-201ENST00000331444 IFT140Q96RY7 1462 aa35.57■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 TOPBP1Q92547 1522 aa35.52■■■■□ 3.28
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.47■■■■□ 3.27
DGCR6-201ENST00000331444 ABCC8Q09428 1581 aa35.42■■■■□ 3.26
DGCR6-201ENST00000331444 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.38■■■■□ 3.25
DGCR6-201ENST00000331444 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
DGCR6-201ENST00000331444 ARHGEF11O15085 1522 aa35.31■■■■□ 3.24
DGCR6-201ENST00000331444 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
DGCR6-201ENST00000331444 CHD1O14646 1710 aa35.2■■■■□ 3.23
DGCR6-201ENST00000331444 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
DGCR6-201ENST00000331444 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
DGCR6-201ENST00000331444 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.97■■■■□ 3.19
DGCR6-201ENST00000331444 ARAP1Q96P48 1450 aa34.94■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.93■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 WDR97A6NE52 1622 aa34.92■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 SOGA1O94964 1423 aa34.9■■■■□ 3.18
DGCR6-201ENST00000331444 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
DGCR6-201ENST00000331444 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.84■■■■□ 3.17
DGCR6-201ENST00000331444 FBLN2P98095 1184 aa34.82■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 CUX1P39880 1505 aa34.81■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.8■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.78■■■■□ 3.16
DGCR6-201ENST00000331444 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
DGCR6-201ENST00000331444 SYNJ1O43426 1573 aa34.67■■■■□ 3.14
DGCR6-201ENST00000331444 GRIN2BQ13224 1484 aa34.66■■■■□ 3.14
DGCR6-201ENST00000331444 SYNJ2O15056 1496 aa34.6■■■■□ 3.13
DGCR6-201ENST00000331444 PBRM1Q86U86 1689 aa34.6■■■■□ 3.13
DGCR6-201ENST00000331444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
DGCR6-201ENST00000331444 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
DGCR6-201ENST00000331444 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.5■■■■□ 3.11
DGCR6-201ENST00000331444 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.49■■■■□ 3.11
DGCR6-201ENST00000331444 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.48■■■■□ 3.11
DGCR6-201ENST00000331444 GRIN2AQ12879 1464 aa34.24■■■■□ 3.07
DGCR6-201ENST00000331444 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.22■■■■□ 3.07
DGCR6-201ENST00000331444 ADAMTS12P58397 1594 aa34.22■■■■□ 3.07
DGCR6-201ENST00000331444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.19■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 TOP2BQ02880 1626 aa34.19■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 NUP160Q12769 1436 aa34.18■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 CEP170Q5SW79 1584 aa34.16■■■■□ 3.06
DGCR6-201ENST00000331444 SHROOM2Q13796 1616 aa34.12■■■■□ 3.05
DGCR6-201ENST00000331444 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
DGCR6-201ENST00000331444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.05■■■■□ 3.04
DGCR6-201ENST00000331444 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.04■■■■□ 3.04
DGCR6-201ENST00000331444 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.85■■■■□ 3.01
DGCR6-201ENST00000331444 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
DGCR6-201ENST00000331444 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
DGCR6-201ENST00000331444 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms