RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367995.3

ADAMTS4-201, Transcript of ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ADAMTS4, Length 1,961 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAMTS4-201ENST00000367995 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.12■■■■□ 3.53
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ADAMTS4-201ENST00000367995 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.7■■■□□ 2.51
ADAMTS4-201ENST00000367995 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.61■■■□□ 2.49
ADAMTS4-201ENST00000367995 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.52■■■□□ 2.48
ADAMTS4-201ENST00000367995 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.16■■■□□ 2.42
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ADAMTS4-201ENST00000367995 SCRIBQ14160 1630 aa29.66■■■□□ 2.34
ADAMTS4-201ENST00000367995 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.5■■■□□ 2.31
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ADAMTS4-201ENST00000367995 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.69■■■□□ 2.18
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ADAMTS4-201ENST00000367995 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.64■■■□□ 2.17
ADAMTS4-201ENST00000367995 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.57■■■□□ 2.16
ADAMTS4-201ENST00000367995 WIZO95785 1651 aa28.5■■■□□ 2.15
ADAMTS4-201ENST00000367995 SMARCA4P51532 1647 aa28.45■■■□□ 2.15
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ADAMTS4-201ENST00000367995 SMARCA2P51531 1590 aa27.96■■■□□ 2.07
ADAMTS4-201ENST00000367995 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.92■■■□□ 2.06
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ADAMTS4-201ENST00000367995 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.85■■■□□ 2.05
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ADAMTS4-201ENST00000367995 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.55■■■□□ 2
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ADAMTS4-201ENST00000367995 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
ADAMTS4-201ENST00000367995 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.17■■□□□ 1.94
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ADAMTS4-201ENST00000367995 TOP2BQ02880 1626 aa27■■□□□ 1.91
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ADAMTS4-201ENST00000367995 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.92■■□□□ 1.9
ADAMTS4-201ENST00000367995 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.92■■□□□ 1.9
ADAMTS4-201ENST00000367995 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.87■■□□□ 1.89
ADAMTS4-201ENST00000367995 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.8■■□□□ 1.88
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ADAMTS4-201ENST00000367995 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.78■■□□□ 1.88
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ADAMTS4-201ENST00000367995 KIF27Q86VH2 1401 aa26.55■■□□□ 1.84
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ADAMTS4-201ENST00000367995 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.5■■□□□ 1.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 NESP48681 1621 aa26.48■■□□□ 1.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 PRXQ9BXM0 1461 aa26.47■■□□□ 1.83
ADAMTS4-201ENST00000367995 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.45■■□□□ 1.82
ADAMTS4-201ENST00000367995 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.44■■□□□ 1.82
ADAMTS4-201ENST00000367995 HRCP23327 699 aa26.42■■□□□ 1.82
ADAMTS4-201ENST00000367995 CUX2O14529 1486 aa26.37■■□□□ 1.81
ADAMTS4-201ENST00000367995 CLIP1P30622 1438 aa26.36■■□□□ 1.81
ADAMTS4-201ENST00000367995 TOPBP1Q92547 1522 aa26.35■■□□□ 1.81
ADAMTS4-201ENST00000367995 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.32■■□□□ 1.8
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ADAMTS4-201ENST00000367995 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
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ADAMTS4-201ENST00000367995 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.19■■□□□ 1.78
ADAMTS4-201ENST00000367995 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.16■■□□□ 1.78
ADAMTS4-201ENST00000367995 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.12■■□□□ 1.77
ADAMTS4-201ENST00000367995 WDR97A6NE52 1622 aa26.11■■□□□ 1.77
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ADAMTS4-201ENST00000367995 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.98■■□□□ 1.75
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ADAMTS4-201ENST00000367995 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
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ADAMTS4-201ENST00000367995 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
ADAMTS4-201ENST00000367995 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.83■■□□□ 1.73
ADAMTS4-201ENST00000367995 WDR62O43379 1518 aa25.8■■□□□ 1.72
ADAMTS4-201ENST00000367995 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.76■■□□□ 1.71
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ADAMTS4-201ENST00000367995 ERCC6Q03468 1493 aa25.71■■□□□ 1.71
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