RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591913.2

NTF6B-201, Transcript of neurotrophin 6 beta (pseudogene), humanhuman

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Gene NTF6B, Length 560 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF6B-201ENST00000591913 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.85■■■■■ 5.09
NTF6B-201ENST00000591913 ABCC9O60706 1549 aa42.3■■■■■ 4.36
NTF6B-201ENST00000591913 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.05■■■■■ 4.32
NTF6B-201ENST00000591913 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.12■■■■■ 4.01
NTF6B-201ENST00000591913 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.84■■■■□ 3.97
NTF6B-201ENST00000591913 NACADO15069 1562 aa39.8■■■■□ 3.96
NTF6B-201ENST00000591913 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.73■■■■□ 3.95
NTF6B-201ENST00000591913 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
NTF6B-201ENST00000591913 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.26■■■■□ 3.88
NTF6B-201ENST00000591913 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.17■■■■□ 3.86
NTF6B-201ENST00000591913 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.99■■■■□ 3.83
NTF6B-201ENST00000591913 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
NTF6B-201ENST00000591913 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.63■■■■□ 3.78
NTF6B-201ENST00000591913 SCRIBQ14160 1630 aa38.4■■■■□ 3.74
NTF6B-201ENST00000591913 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.35■■■■□ 3.73
NTF6B-201ENST00000591913 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.16■■■■□ 3.7
NTF6B-201ENST00000591913 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.09■■■■□ 3.69
NTF6B-201ENST00000591913 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.03■■■■□ 3.68
NTF6B-201ENST00000591913 NCAPD3P42695 1498 aa36.76■■■■□ 3.48
NTF6B-201ENST00000591913 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.66■■■■□ 3.46
NTF6B-201ENST00000591913 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.62■■■■□ 3.45
NTF6B-201ENST00000591913 SMARCA4P51532 1647 aa36.58■■■■□ 3.45
NTF6B-201ENST00000591913 SMARCA2P51531 1590 aa36.52■■■■□ 3.44
NTF6B-201ENST00000591913 ERCC6Q03468 1493 aa36.5■■■■□ 3.43
NTF6B-201ENST00000591913 HMGXB3Q12766 1538 aa36.45■■■■□ 3.43
NTF6B-201ENST00000591913 CUX2O14529 1486 aa36.43■■■■□ 3.42
NTF6B-201ENST00000591913 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
NTF6B-201ENST00000591913 NESP48681 1621 aa36.3■■■■□ 3.4
NTF6B-201ENST00000591913 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
NTF6B-201ENST00000591913 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.18■■■■□ 3.38
NTF6B-201ENST00000591913 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.14■■■■□ 3.38
NTF6B-201ENST00000591913 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.94■■■■□ 3.34
NTF6B-201ENST00000591913 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
NTF6B-201ENST00000591913 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.8■■■■□ 3.32
NTF6B-201ENST00000591913 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.76■■■■□ 3.32
NTF6B-201ENST00000591913 WIZO95785 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
NTF6B-201ENST00000591913 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.66■■■■□ 3.3
NTF6B-201ENST00000591913 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.47■■■■□ 3.27
NTF6B-201ENST00000591913 WDR62O43379 1518 aa35.37■■■■□ 3.25
NTF6B-201ENST00000591913 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
NTF6B-201ENST00000591913 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
NTF6B-201ENST00000591913 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.27■■■■□ 3.24
NTF6B-201ENST00000591913 CFTRP13569 1480 aa35.22■■■■□ 3.23
NTF6B-201ENST00000591913 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
NTF6B-201ENST00000591913 TRIM41Q8WV44 630 aa35.03■■■■□ 3.2
NTF6B-201ENST00000591913 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
NTF6B-201ENST00000591913 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.84■■■■□ 3.17
NTF6B-201ENST00000591913 PRDM2Q13029 1718 aa34.84■■■■□ 3.17
NTF6B-201ENST00000591913 OSCARQ8IYS5 282 aa34.81■■■■□ 3.16
NTF6B-201ENST00000591913 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
NTF6B-201ENST00000591913 IFT140Q96RY7 1462 aa34.59■■■■□ 3.13
NTF6B-201ENST00000591913 TOPBP1Q92547 1522 aa34.59■■■■□ 3.13
NTF6B-201ENST00000591913 ABCC8Q09428 1581 aa34.45■■■■□ 3.11
NTF6B-201ENST00000591913 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.43■■■■□ 3.1
NTF6B-201ENST00000591913 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.36■■■■□ 3.09
NTF6B-201ENST00000591913 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.36■■■■□ 3.09
NTF6B-201ENST00000591913 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.36■■■■□ 3.09
NTF6B-201ENST00000591913 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
NTF6B-201ENST00000591913 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.28■■■■□ 3.08
NTF6B-201ENST00000591913 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
NTF6B-201ENST00000591913 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
NTF6B-201ENST00000591913 ARHGEF11O15085 1522 aa34.22■■■■□ 3.07
NTF6B-201ENST00000591913 CHD1O14646 1710 aa34.16■■■■□ 3.06
NTF6B-201ENST00000591913 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.14■■■■□ 3.06
NTF6B-201ENST00000591913 FBLN2P98095 1184 aa34.12■■■■□ 3.05
NTF6B-201ENST00000591913 SOGA1O94964 1423 aa34.09■■■■□ 3.05
NTF6B-201ENST00000591913 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
NTF6B-201ENST00000591913 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.05■■■■□ 3.04
NTF6B-201ENST00000591913 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34■■■■□ 3.03
NTF6B-201ENST00000591913 CUX1P39880 1505 aa33.95■■■■□ 3.03
NTF6B-201ENST00000591913 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.9■■■■□ 3.02
NTF6B-201ENST00000591913 ARAP1Q96P48 1450 aa33.89■■■■□ 3.02
NTF6B-201ENST00000591913 WDR97A6NE52 1622 aa33.85■■■■□ 3.01
NTF6B-201ENST00000591913 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
NTF6B-201ENST00000591913 GRIN2BQ13224 1484 aa33.78■■■■□ 3
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NTF6B-201ENST00000591913 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
NTF6B-201ENST00000591913 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.74■■■□□ 2.99
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NTF6B-201ENST00000591913 SYNJ1O43426 1573 aa33.7■■■□□ 2.99
NTF6B-201ENST00000591913 SYNJ2O15056 1496 aa33.67■■■□□ 2.98
NTF6B-201ENST00000591913 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.65■■■□□ 2.98
NTF6B-201ENST00000591913 PBRM1Q86U86 1689 aa33.64■■■□□ 2.98
NTF6B-201ENST00000591913 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.58■■■□□ 2.97
NTF6B-201ENST00000591913 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.53■■■□□ 2.96
NTF6B-201ENST00000591913 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.43■■■□□ 2.94
NTF6B-201ENST00000591913 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.35■■■□□ 2.93
NTF6B-201ENST00000591913 GRIN2AQ12879 1464 aa33.34■■■□□ 2.93
NTF6B-201ENST00000591913 TOP2BQ02880 1626 aa33.34■■■□□ 2.93
NTF6B-201ENST00000591913 ADAMTS12P58397 1594 aa33.3■■■□□ 2.92
NTF6B-201ENST00000591913 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.26■■■□□ 2.92
NTF6B-201ENST00000591913 CEP170Q5SW79 1584 aa33.24■■■□□ 2.91
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NTF6B-201ENST00000591913 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.14■■■□□ 2.9
NTF6B-201ENST00000591913 SHROOM2Q13796 1616 aa33.08■■■□□ 2.89
NTF6B-201ENST00000591913 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
NTF6B-201ENST00000591913 JPH4Q96JJ6 628 aa32.94■■■□□ 2.86
NTF6B-201ENST00000591913 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.82■■■□□ 2.85
NTF6B-201ENST00000591913 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
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