RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587760.5

NFIX-209, Transcript of nuclear factor I X, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFIX, Length 1,487 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIX-209ENST00000587760 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.05■■■■□ 3.68
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NFIX-209ENST00000587760 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.25■■■□□ 2.59
NFIX-209ENST00000587760 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.2■■■□□ 2.58
NFIX-209ENST00000587760 ABCC9O60706 1549 aa31.11■■■□□ 2.57
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NFIX-209ENST00000587760 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.91■■■□□ 2.54
NFIX-209ENST00000587760 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.6■■■□□ 2.49
NFIX-209ENST00000587760 SCRIBQ14160 1630 aa30.39■■■□□ 2.46
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NFIX-209ENST00000587760 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
NFIX-209ENST00000587760 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.43■■■□□ 2.3
NFIX-209ENST00000587760 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
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NFIX-209ENST00000587760 SMARCA4P51532 1647 aa29.22■■■□□ 2.27
NFIX-209ENST00000587760 WIZO95785 1651 aa29.07■■■□□ 2.24
NFIX-209ENST00000587760 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.93■■■□□ 2.22
NFIX-209ENST00000587760 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NFIX-209ENST00000587760 SMARCA2P51531 1590 aa28.79■■■□□ 2.2
NFIX-209ENST00000587760 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.7■■■□□ 2.18
NFIX-209ENST00000587760 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.7■■■□□ 2.18
NFIX-209ENST00000587760 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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NFIX-209ENST00000587760 NCAPD3P42695 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
NFIX-209ENST00000587760 HMGXB3Q12766 1538 aa28.49■■■□□ 2.15
NFIX-209ENST00000587760 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.2■■■□□ 2.11
NFIX-209ENST00000587760 TRIM41Q8WV44 630 aa28.18■■■□□ 2.1
NFIX-209ENST00000587760 ABCC8Q09428 1581 aa27.89■■■□□ 2.05
NFIX-209ENST00000587760 CFTRP13569 1480 aa27.87■■■□□ 2.05
NFIX-209ENST00000587760 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
NFIX-209ENST00000587760 PRDM2Q13029 1718 aa27.77■■■□□ 2.04
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NFIX-209ENST00000587760 SYNJ1O43426 1573 aa27.63■■■□□ 2.01
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NFIX-209ENST00000587760 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.58■■■□□ 2.01
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NFIX-209ENST00000587760 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
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NFIX-209ENST00000587760 CUX1P39880 1505 aa27.42■■□□□ 1.98
NFIX-209ENST00000587760 SOGA1O94964 1423 aa27.4■■□□□ 1.98
NFIX-209ENST00000587760 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.33■■□□□ 1.97
NFIX-209ENST00000587760 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.32■■□□□ 1.96
NFIX-209ENST00000587760 NESP48681 1621 aa27.31■■□□□ 1.96
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NFIX-209ENST00000587760 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.92■■□□□ 1.9
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NFIX-209ENST00000587760 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.88■■□□□ 1.89
NFIX-209ENST00000587760 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.82■■□□□ 1.88
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NFIX-209ENST00000587760 WDR97A6NE52 1622 aa26.82■■□□□ 1.88
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NFIX-209ENST00000587760 WDR62O43379 1518 aa26.76■■□□□ 1.87
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NFIX-209ENST00000587760 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.7■■□□□ 1.86
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NFIX-209ENST00000587760 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.4■■□□□ 1.82
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NFIX-209ENST00000587760 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.818e-7■■■■□ 22.8
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NFIX-209ENST00000587760 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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