Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 DPY19L2-202ENST00000324472 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 54.9
DKC1O60832 DPY19L2-203ENST00000413230 1339 ntTSL 28.07□□□□□ -1.121e-10■■■■■ 54.9
DKC1O60832 DPY19L2-204ENST00000439061 1173 ntTSL 53.99□□□□□ -1.771e-10■■■■■ 54.9
DKC1O60832 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 54.7
DKC1O60832 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.12e-8■■■■■ 54.7
DKC1O60832 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 54.7
DKC1O60832 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 510.33□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 54.5
DKC1O60832 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 54.4
DKC1O60832 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 54.4
DKC1O60832 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 54.4
DKC1O60832 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.8□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 54.3
DKC1O60832 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 54.3
DKC1O60832 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 320.51■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 54.3
DKC1O60832 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 220.27■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 54.3
DKC1O60832 CTIF-203ENST00000587752 683 ntTSL 516.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.3
DKC1O60832 CTIF-210ENST00000591412 491 ntTSL 314.89□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 54.3
DKC1O60832 ACTN1-220ENST00000556433 1259 ntTSL 325.34■■□□□ 1.651e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 310.75□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 49.82□□□□□ -0.841e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.111e-323■■■■■ 54.2
DKC1O60832 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 54.2
DKC1O60832 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 54.2
DKC1O60832 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.641e-323■■■■■ 54.2
DKC1O60832 FOXN3-204ENST00000553840 555 ntTSL 419.92■□□□□ 0.783e-10■■■■■ 54.2
DKC1O60832 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.163e-10■■■■■ 54.2
DKC1O60832 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 54.2
DKC1O60832 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 56.56□□□□□ -1.363e-10■■■■■ 54.2
DKC1O60832 INHA-202ENST00000489456 645 ntTSL 215.76■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 54.2
DKC1O60832 TCF7L2-223ENST00000629706 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-204ENST00000352065 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.996e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.246e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.286e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.416e-7■■■■■ 53.9
DKC1O60832 EIF4A1-222ENST00000582050 576 ntTSL 520.14■□□□□ 0.811e-323■■■■■ 53.9
DKC1O60832 EIF4A1-221ENST00000581841 621 ntTSL 211.14□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 53.9
DKC1O60832 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.441e-323■■■■■ 53.9
DKC1O60832 EIF4A1-220ENST00000581808 205 ntTSL 34.37□□□□□ -1.711e-323■■■■■ 53.9
DKC1O60832 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.591e-9■■■■■ 53.9
DKC1O60832 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.18□□□□□ -1.581e-9■■■■■ 53.9
DKC1O60832 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.587e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.577e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.257e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-205ENST00000471586 584 ntTSL 310.65□□□□□ -0.77e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-210ENST00000485244 560 ntTSL 410.16□□□□□ -0.787e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-212ENST00000494754 566 ntTSL 49.18□□□□□ -0.947e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.967e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 WWTR1-206ENST00000472417 955 ntTSL 38.88□□□□□ -0.997e-12■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-212ENST00000636194 8508 ntTSL 56.7□□□□□ -1.346e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.416e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.486e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.596e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.05□□□□□ -1.66e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-221ENST00000641996 12903 nt3.79□□□□□ -1.86e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.18□□□□□ -1.96e-8■■■■■ 53.6
DKC1O60832 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 32.74□□□□□ -1.971e-323■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.721e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-203ENST00000504085 1123 ntTSL 1 (best)17.66■□□□□ 0.421e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-213ENST00000514589 2443 ntTSL 215.77■□□□□ 0.111e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.21e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-211ENST00000513909 728 ntTSL 36.76□□□□□ -1.331e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-204ENST00000505105 1304 ntTSL 1 (best)6.02□□□□□ -1.451e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 RCHY1-207ENST00000512567 1164 ntTSL 1 (best)4.15□□□□□ -1.751e-11■■■■■ 53.6
DKC1O60832 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.731e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-201ENST00000461448 1629 ntTSL 1 (best)21.91■■□□□ 1.11e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-208ENST00000481220 751 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-206ENST00000474814 1903 ntTSL 219.53■□□□□ 0.721e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.241e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-209ENST00000481368 1588 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.171e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-205ENST00000470977 1098 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.121e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-211ENST00000488745 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.781e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.211e-323■■■■■ 53.4
DKC1O60832 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-16■■■■■ 53.2
DKC1O60832 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.042e-16■■■■■ 53.2
DKC1O60832 LIPA-204ENST00000428800 1055 ntTSL 1 (best)14.15□□□□□ -0.142e-16■■■■■ 53.2
DKC1O60832 LIPA-201ENST00000282673 753 ntTSL 310.02□□□□□ -0.812e-16■■■■■ 53.2
DKC1O60832 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.112e-16■■■■■ 53.2
DKC1O60832 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.274e-10■■■■■ 53.1
DKC1O60832 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 53.1
DKC1O60832 FOXN3-202ENST00000345097 7832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-10■■■■■ 53.1
DKC1O60832 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.8□□□□□ -2.281e-323■■■■■ 53.1
DKC1O60832 DKC1-209ENST00000475966 902 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-42■■■■■ 53.1
DKC1O60832 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 53
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