RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.73■■■■■ 4.91
CTIF-206ENST00000588345 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41■■■■■ 4.15
CTIF-206ENST00000588345 ABCC9O60706 1549 aa40.7■■■■■ 4.11
CTIF-206ENST00000588345 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.89■■■■□ 3.82
CTIF-206ENST00000588345 NACADO15069 1562 aa38.7■■■■□ 3.79
CTIF-206ENST00000588345 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.35■■■■□ 3.73
CTIF-206ENST00000588345 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.28■■■■□ 3.72
CTIF-206ENST00000588345 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.03■■■■□ 3.68
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.02■■■■□ 3.68
CTIF-206ENST00000588345 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.96■■■■□ 3.67
CTIF-206ENST00000588345 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
CTIF-206ENST00000588345 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.85■■■■□ 3.65
CTIF-206ENST00000588345 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.77■■■■□ 3.64
CTIF-206ENST00000588345 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.34■■■■□ 3.57
CTIF-206ENST00000588345 SCRIBQ14160 1630 aa37.28■■■■□ 3.56
CTIF-206ENST00000588345 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.81■■■■□ 3.48
CTIF-206ENST00000588345 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CTIF-206ENST00000588345 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.67■■■■□ 3.46
CTIF-206ENST00000588345 NCAPD3P42695 1498 aa35.72■■■■□ 3.31
CTIF-206ENST00000588345 SMARCA4P51532 1647 aa35.63■■■■□ 3.29
CTIF-206ENST00000588345 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
CTIF-206ENST00000588345 SMARCA2P51531 1590 aa35.54■■■■□ 3.28
CTIF-206ENST00000588345 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CTIF-206ENST00000588345 HMGXB3Q12766 1538 aa35.48■■■■□ 3.27
CTIF-206ENST00000588345 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.34■■■■□ 3.25
CTIF-206ENST00000588345 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
CTIF-206ENST00000588345 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.21■■■■□ 3.23
CTIF-206ENST00000588345 ERCC6Q03468 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
CTIF-206ENST00000588345 CUX2O14529 1486 aa35.07■■■■□ 3.2
CTIF-206ENST00000588345 NESP48681 1621 aa35.03■■■■□ 3.2
CTIF-206ENST00000588345 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.88■■■■□ 3.17
CTIF-206ENST00000588345 WIZO95785 1651 aa34.79■■■■□ 3.16
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.79■■■■□ 3.16
CTIF-206ENST00000588345 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
CTIF-206ENST00000588345 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.64■■■■□ 3.14
CTIF-206ENST00000588345 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.62■■■■□ 3.13
CTIF-206ENST00000588345 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.62■■■■□ 3.13
CTIF-206ENST00000588345 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
CTIF-206ENST00000588345 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
CTIF-206ENST00000588345 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.33■■■■□ 3.09
CTIF-206ENST00000588345 CFTRP13569 1480 aa34.28■■■■□ 3.08
CTIF-206ENST00000588345 WDR62O43379 1518 aa34.27■■■■□ 3.08
CTIF-206ENST00000588345 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.22■■■■□ 3.07
CTIF-206ENST00000588345 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.2■■■■□ 3.07
CTIF-206ENST00000588345 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.98■■■■□ 3.03
CTIF-206ENST00000588345 PRDM2Q13029 1718 aa33.98■■■■□ 3.03
CTIF-206ENST00000588345 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
CTIF-206ENST00000588345 TOPBP1Q92547 1522 aa33.59■■■□□ 2.97
CTIF-206ENST00000588345 ABCC8Q09428 1581 aa33.56■■■□□ 2.96
CTIF-206ENST00000588345 IFT140Q96RY7 1462 aa33.56■■■□□ 2.96
CTIF-206ENST00000588345 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.5■■■□□ 2.95
CTIF-206ENST00000588345 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CTIF-206ENST00000588345 OSCARQ8IYS5 282 aa33.44■■■□□ 2.94
CTIF-206ENST00000588345 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
CTIF-206ENST00000588345 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
CTIF-206ENST00000588345 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.92
CTIF-206ENST00000588345 TRIM41Q8WV44 630 aa33.24■■■□□ 2.91
CTIF-206ENST00000588345 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.16■■■□□ 2.9
CTIF-206ENST00000588345 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.11■■■□□ 2.89
CTIF-206ENST00000588345 SOGA1O94964 1423 aa33.09■■■□□ 2.89
CTIF-206ENST00000588345 CUX1P39880 1505 aa33.07■■■□□ 2.89
CTIF-206ENST00000588345 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.07■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 WDR97A6NE52 1622 aa33.02■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 CHD1O14646 1710 aa33.02■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.02■■■□□ 2.88
CTIF-206ENST00000588345 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF11O15085 1522 aa32.93■■■□□ 2.86
CTIF-206ENST00000588345 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.84■■■□□ 2.85
CTIF-206ENST00000588345 FBLN2P98095 1184 aa32.83■■■□□ 2.85
CTIF-206ENST00000588345 GRIN2BQ13224 1484 aa32.8■■■□□ 2.84
CTIF-206ENST00000588345 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
CTIF-206ENST00000588345 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.74■■■□□ 2.83
CTIF-206ENST00000588345 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.7■■■□□ 2.83
CTIF-206ENST00000588345 PBRM1Q86U86 1689 aa32.69■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 SYNJ2O15056 1496 aa32.68■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.68■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.67■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 SYNJ1O43426 1573 aa32.65■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.64■■■□□ 2.82
CTIF-206ENST00000588345 TOP2BQ02880 1626 aa32.62■■■□□ 2.81
CTIF-206ENST00000588345 ARAP1Q96P48 1450 aa32.62■■■□□ 2.81
CTIF-206ENST00000588345 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.819e-6■■■■■ 50.1
CTIF-206ENST00000588345 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.6■■■□□ 2.81
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTS12P58397 1594 aa32.41■■■□□ 2.78
CTIF-206ENST00000588345 GRIN2AQ12879 1464 aa32.39■■■□□ 2.78
CTIF-206ENST00000588345 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.33■■■□□ 2.77
CTIF-206ENST00000588345 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.31■■■□□ 2.76
CTIF-206ENST00000588345 NUP160Q12769 1436 aa32.29■■■□□ 2.76
CTIF-206ENST00000588345 CEP170Q5SW79 1584 aa32.26■■■□□ 2.75
CTIF-206ENST00000588345 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
CTIF-206ENST00000588345 SHROOM2Q13796 1616 aa32.15■■■□□ 2.74
CTIF-206ENST00000588345 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.13■■■□□ 2.73
CTIF-206ENST00000588345 KIF27Q86VH2 1401 aa31.96■■■□□ 2.71
CTIF-206ENST00000588345 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.95■■■□□ 2.7
CTIF-206ENST00000588345 IGF1RP08069 1367 aa31.93■■■□□ 2.7
CTIF-206ENST00000588345 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
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