RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.1■■■■□ 3.53
CTIF-203ENST00000587752 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.11■■■□□ 2.89
CTIF-203ENST00000587752 ABCC9O60706 1549 aa32.91■■■□□ 2.86
CTIF-203ENST00000587752 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.39■■■□□ 2.62
CTIF-203ENST00000587752 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.32■■■□□ 2.6
CTIF-203ENST00000587752 NACADO15069 1562 aa31.23■■■□□ 2.59
CTIF-203ENST00000587752 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.85■■■□□ 2.53
CTIF-203ENST00000587752 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CTIF-203ENST00000587752 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.72■■■□□ 2.51
CTIF-203ENST00000587752 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.72■■■□□ 2.51
CTIF-203ENST00000587752 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.6■■■□□ 2.49
CTIF-203ENST00000587752 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.57■■■□□ 2.48
CTIF-203ENST00000587752 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.47■■■□□ 2.47
CTIF-203ENST00000587752 SCRIBQ14160 1630 aa30.3■■■□□ 2.44
CTIF-203ENST00000587752 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.99■■■□□ 2.39
CTIF-203ENST00000587752 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.7■■■□□ 2.34
CTIF-203ENST00000587752 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CTIF-203ENST00000587752 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.56■■■□□ 2.32
CTIF-203ENST00000587752 SMARCA4P51532 1647 aa28.88■■■□□ 2.21
CTIF-203ENST00000587752 NCAPD3P42695 1498 aa28.83■■■□□ 2.21
CTIF-203ENST00000587752 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.83■■■□□ 2.21
CTIF-203ENST00000587752 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
CTIF-203ENST00000587752 SMARCA2P51531 1590 aa28.74■■■□□ 2.19
CTIF-203ENST00000587752 HMGXB3Q12766 1538 aa28.64■■■□□ 2.18
CTIF-203ENST00000587752 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.64■■■□□ 2.18
CTIF-203ENST00000587752 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CTIF-203ENST00000587752 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.54■■■□□ 2.16
CTIF-203ENST00000587752 ERCC6Q03468 1493 aa28.37■■■□□ 2.13
CTIF-203ENST00000587752 NESP48681 1621 aa28.36■■■□□ 2.13
CTIF-203ENST00000587752 WIZO95785 1651 aa28.32■■■□□ 2.12
CTIF-203ENST00000587752 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CTIF-203ENST00000587752 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.13■■■□□ 2.09
CTIF-203ENST00000587752 CUX2O14529 1486 aa28.13■■■□□ 2.09
CTIF-203ENST00000587752 CADPSQ9ULU8 1353 aa28■■■□□ 2.07
CTIF-203ENST00000587752 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.98■■■□□ 2.07
CTIF-203ENST00000587752 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.98■■■□□ 2.07
CTIF-203ENST00000587752 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CTIF-203ENST00000587752 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
CTIF-203ENST00000587752 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.77■■■□□ 2.04
CTIF-203ENST00000587752 CFTRP13569 1480 aa27.74■■■□□ 2.03
CTIF-203ENST00000587752 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.73■■■□□ 2.03
CTIF-203ENST00000587752 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.7■■■□□ 2.03
CTIF-203ENST00000587752 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.7■■■□□ 2.02
CTIF-203ENST00000587752 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.65■■■□□ 2.02
CTIF-203ENST00000587752 WDR62O43379 1518 aa27.62■■■□□ 2.01
CTIF-203ENST00000587752 PRDM2Q13029 1718 aa27.5■■□□□ 1.99
CTIF-203ENST00000587752 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
CTIF-203ENST00000587752 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CTIF-203ENST00000587752 TOPBP1Q92547 1522 aa27.22■■□□□ 1.95
CTIF-203ENST00000587752 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.13■■□□□ 1.93
CTIF-203ENST00000587752 ABCC8Q09428 1581 aa27.12■■□□□ 1.93
CTIF-203ENST00000587752 IFT140Q96RY7 1462 aa27.11■■□□□ 1.93
CTIF-203ENST00000587752 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CTIF-203ENST00000587752 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
CTIF-203ENST00000587752 OSCARQ8IYS5 282 aa26.95■■□□□ 1.9
CTIF-203ENST00000587752 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTIF-203ENST00000587752 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTIF-203ENST00000587752 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.9
CTIF-203ENST00000587752 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.89■■□□□ 1.9
CTIF-203ENST00000587752 CUX1P39880 1505 aa26.88■■□□□ 1.89
CTIF-203ENST00000587752 SOGA1O94964 1423 aa26.86■■□□□ 1.89
CTIF-203ENST00000587752 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.86■■□□□ 1.89
CTIF-203ENST00000587752 TRIM41Q8WV44 630 aa26.8■■□□□ 1.88
CTIF-203ENST00000587752 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTIF-203ENST00000587752 FBLN2P98095 1184 aa26.7■■□□□ 1.86
CTIF-203ENST00000587752 CHD1O14646 1710 aa26.69■■□□□ 1.86
CTIF-203ENST00000587752 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.62■■□□□ 1.85
CTIF-203ENST00000587752 WDR97A6NE52 1622 aa26.61■■□□□ 1.85
CTIF-203ENST00000587752 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 GRIN2BQ13224 1484 aa26.56■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.849e-6■■■■■ 50.1
CTIF-203ENST00000587752 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.53■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.52■■□□□ 1.84
CTIF-203ENST00000587752 TOP2BQ02880 1626 aa26.51■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.51■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 ARHGEF11O15085 1522 aa26.51■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 PBRM1Q86U86 1689 aa26.5■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.47■■□□□ 1.83
CTIF-203ENST00000587752 SYNJ2O15056 1496 aa26.42■■□□□ 1.82
CTIF-203ENST00000587752 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.35■■□□□ 1.81
CTIF-203ENST00000587752 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.34■■□□□ 1.81
CTIF-203ENST00000587752 ARAP1Q96P48 1450 aa26.29■■□□□ 1.8
CTIF-203ENST00000587752 ADAMTS12P58397 1594 aa26.25■■□□□ 1.79
CTIF-203ENST00000587752 GRIN2AQ12879 1464 aa26.23■■□□□ 1.79
CTIF-203ENST00000587752 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.19■■□□□ 1.78
CTIF-203ENST00000587752 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.19■■□□□ 1.78
CTIF-203ENST00000587752 CEP170Q5SW79 1584 aa26.12■■□□□ 1.77
CTIF-203ENST00000587752 NUP160Q12769 1436 aa26.1■■□□□ 1.77
CTIF-203ENST00000587752 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.03■■□□□ 1.76
CTIF-203ENST00000587752 KIF27Q86VH2 1401 aa26.02■■□□□ 1.76
CTIF-203ENST00000587752 IGF1RP08069 1367 aa25.97■■□□□ 1.75
CTIF-203ENST00000587752 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CTIF-203ENST00000587752 SHROOM2Q13796 1616 aa25.94■■□□□ 1.74
CTIF-203ENST00000587752 CUL7Q14999 1698 aa25.89■■□□□ 1.73
CTIF-203ENST00000587752 JPH4Q96JJ6 628 aa25.88■■□□□ 1.73
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