RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591412.5

CTIF-210, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 491 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-210ENST00000591412 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.15■■■□□ 2.9
CTIF-210ENST00000591412 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.61■■■□□ 2.33
CTIF-210ENST00000591412 ABCC9O60706 1549 aa29.45■■■□□ 2.3
CTIF-210ENST00000591412 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.11■■■□□ 2.09
CTIF-210ENST00000591412 NACADO15069 1562 aa27.99■■■□□ 2.07
CTIF-210ENST00000591412 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.83■■■□□ 2.05
CTIF-210ENST00000591412 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.7■■■□□ 2.02
CTIF-210ENST00000591412 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.52■■■□□ 2
CTIF-210ENST00000591412 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.51■■■□□ 2
CTIF-210ENST00000591412 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
CTIF-210ENST00000591412 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.44■■□□□ 1.98
CTIF-210ENST00000591412 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.41■■□□□ 1.98
CTIF-210ENST00000591412 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.31■■□□□ 1.96
CTIF-210ENST00000591412 SCRIBQ14160 1630 aa26.99■■□□□ 1.91
CTIF-210ENST00000591412 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.97■■□□□ 1.91
CTIF-210ENST00000591412 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.61■■□□□ 1.85
CTIF-210ENST00000591412 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CTIF-210ENST00000591412 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.52■■□□□ 1.84
CTIF-210ENST00000591412 NCAPD3P42695 1498 aa25.86■■□□□ 1.73
CTIF-210ENST00000591412 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.81■■□□□ 1.72
CTIF-210ENST00000591412 SMARCA4P51532 1647 aa25.79■■□□□ 1.72
CTIF-210ENST00000591412 SMARCA2P51531 1590 aa25.7■■□□□ 1.71
CTIF-210ENST00000591412 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CTIF-210ENST00000591412 HMGXB3Q12766 1538 aa25.66■■□□□ 1.7
CTIF-210ENST00000591412 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.57■■□□□ 1.68
CTIF-210ENST00000591412 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.54■■□□□ 1.68
CTIF-210ENST00000591412 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CTIF-210ENST00000591412 ERCC6Q03468 1493 aa25.39■■□□□ 1.65
CTIF-210ENST00000591412 NESP48681 1621 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-210ENST00000591412 CUX2O14529 1486 aa25.32■■□□□ 1.64
CTIF-210ENST00000591412 WIZO95785 1651 aa25.21■■□□□ 1.63
CTIF-210ENST00000591412 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.2■■□□□ 1.62
CTIF-210ENST00000591412 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.11■■□□□ 1.61
CTIF-210ENST00000591412 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTIF-210ENST00000591412 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.08■■□□□ 1.61
CTIF-210ENST00000591412 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTIF-210ENST00000591412 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.06■■□□□ 1.6
CTIF-210ENST00000591412 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25■■□□□ 1.59
CTIF-210ENST00000591412 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTIF-210ENST00000591412 CFTRP13569 1480 aa24.83■■□□□ 1.57
CTIF-210ENST00000591412 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.83■■□□□ 1.57
CTIF-210ENST00000591412 WDR62O43379 1518 aa24.78■■□□□ 1.56
CTIF-210ENST00000591412 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.77■■□□□ 1.56
CTIF-210ENST00000591412 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.77■■□□□ 1.56
CTIF-210ENST00000591412 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.66■■□□□ 1.54
CTIF-210ENST00000591412 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CTIF-210ENST00000591412 PRDM2Q13029 1718 aa24.51■■□□□ 1.51
CTIF-210ENST00000591412 TOPBP1Q92547 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
CTIF-210ENST00000591412 IFT140Q96RY7 1462 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-210ENST00000591412 ABCC8Q09428 1581 aa24.28■■□□□ 1.48
CTIF-210ENST00000591412 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTIF-210ENST00000591412 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.24■■□□□ 1.47
CTIF-210ENST00000591412 OSCARQ8IYS5 282 aa24.19■■□□□ 1.46
CTIF-210ENST00000591412 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTIF-210ENST00000591412 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CTIF-210ENST00000591412 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTIF-210ENST00000591412 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
CTIF-210ENST00000591412 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
CTIF-210ENST00000591412 TRIM41Q8WV44 630 aa24.03■■□□□ 1.44
CTIF-210ENST00000591412 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24■■□□□ 1.43
CTIF-210ENST00000591412 CUX1P39880 1505 aa23.99■■□□□ 1.43
CTIF-210ENST00000591412 SOGA1O94964 1423 aa23.98■■□□□ 1.43
CTIF-210ENST00000591412 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.96■■□□□ 1.43
CTIF-210ENST00000591412 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTIF-210ENST00000591412 WDR97A6NE52 1622 aa23.85■■□□□ 1.41
CTIF-210ENST00000591412 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-210ENST00000591412 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-210ENST00000591412 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.83■■□□□ 1.41
CTIF-210ENST00000591412 CHD1O14646 1710 aa23.82■■□□□ 1.4
CTIF-210ENST00000591412 ARHGEF11O15085 1522 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-210ENST00000591412 FBLN2P98095 1184 aa23.79■■□□□ 1.4
CTIF-210ENST00000591412 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.78■■□□□ 1.4
CTIF-210ENST00000591412 GRIN2BQ13224 1484 aa23.75■■□□□ 1.39
CTIF-210ENST00000591412 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CTIF-210ENST00000591412 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.72■■□□□ 1.39
CTIF-210ENST00000591412 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.68■■□□□ 1.38
CTIF-210ENST00000591412 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTIF-210ENST00000591412 SYNJ2O15056 1496 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-210ENST00000591412 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.65■■□□□ 1.38
CTIF-210ENST00000591412 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.65■■□□□ 1.389e-6■■■■■ 50.1
CTIF-210ENST00000591412 TOP2BQ02880 1626 aa23.63■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.62■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 SYNJ1O43426 1573 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 PBRM1Q86U86 1689 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.61■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 ARAP1Q96P48 1450 aa23.59■■□□□ 1.37
CTIF-210ENST00000591412 ADAMTS12P58397 1594 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-210ENST00000591412 GRIN2AQ12879 1464 aa23.44■■□□□ 1.34
CTIF-210ENST00000591412 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.41■■□□□ 1.34
CTIF-210ENST00000591412 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.41■■□□□ 1.34
CTIF-210ENST00000591412 NUP160Q12769 1436 aa23.39■■□□□ 1.33
CTIF-210ENST00000591412 CEP170Q5SW79 1584 aa23.35■■□□□ 1.33
CTIF-210ENST00000591412 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.27■■□□□ 1.32
CTIF-210ENST00000591412 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CTIF-210ENST00000591412 SHROOM2Q13796 1616 aa23.23■■□□□ 1.31
CTIF-210ENST00000591412 IGF1RP08069 1367 aa23.2■■□□□ 1.3
CTIF-210ENST00000591412 KIF27Q86VH2 1401 aa23.18■■□□□ 1.3
CTIF-210ENST00000591412 JPH4Q96JJ6 628 aa23.14■■□□□ 1.29
CTIF-210ENST00000591412 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
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