Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DFNA5O60443 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DFNA5O60443 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DFNA5O60443 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms