Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAMD12Q8N8I0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms