RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253496.3

F12-201, Transcript of coagulation factor XII, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene F12, Length 2,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F12-201ENST00000253496 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.87■■■■□ 3.81
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F12-201ENST00000253496 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.47■■■□□ 2.79
F12-201ENST00000253496 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.03■■■□□ 2.72
F12-201ENST00000253496 NACADO15069 1562 aa31.91■■■□□ 2.7
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F12-201ENST00000253496 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.8■■■□□ 2.68
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F12-201ENST00000253496 SCRIBQ14160 1630 aa31.39■■■□□ 2.62
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F12-201ENST00000253496 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.34■■■□□ 2.45
F12-201ENST00000253496 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.06■■■□□ 2.4
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F12-201ENST00000253496 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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F12-201ENST00000253496 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.75■■■□□ 2.35
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F12-201ENST00000253496 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.68■■■□□ 2.34
F12-201ENST00000253496 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.6■■■□□ 2.33
F12-201ENST00000253496 SMARCA2P51531 1590 aa29.58■■■□□ 2.33
F12-201ENST00000253496 NCAPD3P42695 1498 aa29.5■■■□□ 2.31
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F12-201ENST00000253496 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.13■■■□□ 2.25
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F12-201ENST00000253496 CFTRP13569 1480 aa28.69■■■□□ 2.18
F12-201ENST00000253496 TRIM41Q8WV44 630 aa28.64■■■□□ 2.17
F12-201ENST00000253496 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.56■■■□□ 2.16
F12-201ENST00000253496 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.42■■■□□ 2.14
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F12-201ENST00000253496 ABCC8Q09428 1581 aa28.37■■■□□ 2.13
F12-201ENST00000253496 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.33■■■□□ 2.13
F12-201ENST00000253496 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.28■■■□□ 2.12
F12-201ENST00000253496 ERCC6Q03468 1493 aa28.27■■■□□ 2.12
F12-201ENST00000253496 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.27■■■□□ 2.12
F12-201ENST00000253496 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
F12-201ENST00000253496 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
F12-201ENST00000253496 CUX1P39880 1505 aa28.13■■■□□ 2.09
F12-201ENST00000253496 SYNJ1O43426 1573 aa28.13■■■□□ 2.09
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F12-201ENST00000253496 TOP2BQ02880 1626 aa28■■■□□ 2.07
F12-201ENST00000253496 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.95■■■□□ 2.07
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F12-201ENST00000253496 CUX2O14529 1486 aa27.78■■■□□ 2.04
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F12-201ENST00000253496 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.74■■■□□ 2.03
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F12-201ENST00000253496 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
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F12-201ENST00000253496 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.61■■■□□ 2.01
F12-201ENST00000253496 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
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F12-201ENST00000253496 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 21e-6■■■□□ 15
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F12-201ENST00000253496 GRIN2BQ13224 1484 aa27.29■■□□□ 1.96
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F12-201ENST00000253496 PRXQ9BXM0 1461 aa27.23■■□□□ 1.95
F12-201ENST00000253496 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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F12-201ENST00000253496 FBLN2P98095 1184 aa27.14■■□□□ 1.93
F12-201ENST00000253496 ADAMTS12P58397 1594 aa27.12■■□□□ 1.93
F12-201ENST00000253496 CUL7Q14999 1698 aa27.11■■□□□ 1.93
F12-201ENST00000253496 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
F12-201ENST00000253496 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.1■■□□□ 1.93
F12-201ENST00000253496 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
F12-201ENST00000253496 CLIP1P30622 1438 aa27.05■■□□□ 1.92
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