RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.01■■■■■ 5.76
TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.66■■■■■ 4.9
TRAPPC5-201ENST00000317378 ABCC9O60706 1549 aa45.47■■■■■ 4.87
TRAPPC5-201ENST00000317378 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.39■■■■■ 4.54
TRAPPC5-201ENST00000317378 NACADO15069 1562 aa43.17■■■■■ 4.5
TRAPPC5-201ENST00000317378 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.89■■■■■ 4.46
TRAPPC5-201ENST00000317378 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.71■■■■■ 4.43
TRAPPC5-201ENST00000317378 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.61■■■■■ 4.41
TRAPPC5-201ENST00000317378 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.38■■■■■ 4.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.37■■■■■ 4.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
TRAPPC5-201ENST00000317378 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.2■■■■■ 4.35
TRAPPC5-201ENST00000317378 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.15■■■■■ 4.34
TRAPPC5-201ENST00000317378 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.65■■■■■ 4.26
TRAPPC5-201ENST00000317378 SCRIBQ14160 1630 aa41.54■■■■■ 4.24
TRAPPC5-201ENST00000317378 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.11■■■■■ 4.17
TRAPPC5-201ENST00000317378 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
TRAPPC5-201ENST00000317378 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.98■■■■■ 4.15
TRAPPC5-201ENST00000317378 NCAPD3P42695 1498 aa39.9■■■■□ 3.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.76■■■■□ 3.96
TRAPPC5-201ENST00000317378 SMARCA4P51532 1647 aa39.72■■■■□ 3.95
TRAPPC5-201ENST00000317378 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.94
TRAPPC5-201ENST00000317378 HMGXB3Q12766 1538 aa39.56■■■■□ 3.92
TRAPPC5-201ENST00000317378 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
TRAPPC5-201ENST00000317378 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.39■■■■□ 3.9
TRAPPC5-201ENST00000317378 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.33■■■■□ 3.89
TRAPPC5-201ENST00000317378 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.28■■■■□ 3.88
TRAPPC5-201ENST00000317378 ERCC6Q03468 1493 aa39.23■■■■□ 3.87
TRAPPC5-201ENST00000317378 CUX2O14529 1486 aa39.18■■■■□ 3.86
TRAPPC5-201ENST00000317378 NESP48681 1621 aa39.13■■■■□ 3.85
TRAPPC5-201ENST00000317378 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.04■■■■□ 3.84
TRAPPC5-201ENST00000317378 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.91■■■■□ 3.82
TRAPPC5-201ENST00000317378 WIZO95785 1651 aa38.78■■■■□ 3.8
TRAPPC5-201ENST00000317378 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.7■■■■□ 3.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
TRAPPC5-201ENST00000317378 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.68■■■■□ 3.78
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.58■■■■□ 3.77
TRAPPC5-201ENST00000317378 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
TRAPPC5-201ENST00000317378 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
TRAPPC5-201ENST00000317378 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.32■■■■□ 3.72
TRAPPC5-201ENST00000317378 CFTRP13569 1480 aa38.27■■■■□ 3.72
TRAPPC5-201ENST00000317378 WDR62O43379 1518 aa38.23■■■■□ 3.71
TRAPPC5-201ENST00000317378 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.19■■■■□ 3.7
TRAPPC5-201ENST00000317378 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.18■■■■□ 3.7
TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.92■■■■□ 3.66
TRAPPC5-201ENST00000317378 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
TRAPPC5-201ENST00000317378 PRDM2Q13029 1718 aa37.79■■■■□ 3.64
TRAPPC5-201ENST00000317378 TOPBP1Q92547 1522 aa37.48■■■■□ 3.59
TRAPPC5-201ENST00000317378 ABCC8Q09428 1581 aa37.46■■■■□ 3.59
TRAPPC5-201ENST00000317378 IFT140Q96RY7 1462 aa37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC5-201ENST00000317378 OSCARQ8IYS5 282 aa37.45■■■■□ 3.59
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
TRAPPC5-201ENST00000317378 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.34■■■■□ 3.57
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRIM41Q8WV44 630 aa37.25■■■■□ 3.55
TRAPPC5-201ENST00000317378 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
TRAPPC5-201ENST00000317378 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC5-201ENST00000317378 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
TRAPPC5-201ENST00000317378 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.05■■■■□ 3.52
TRAPPC5-201ENST00000317378 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC5-201ENST00000317378 SOGA1O94964 1423 aa36.95■■■■□ 3.51
TRAPPC5-201ENST00000317378 CUX1P39880 1505 aa36.89■■■■□ 3.5
TRAPPC5-201ENST00000317378 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.88■■■■□ 3.5
TRAPPC5-201ENST00000317378 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
TRAPPC5-201ENST00000317378 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC5-201ENST00000317378 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC5-201ENST00000317378 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.86■■■■□ 3.49
TRAPPC5-201ENST00000317378 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
TRAPPC5-201ENST00000317378 WDR97A6NE52 1622 aa36.8■■■■□ 3.48
TRAPPC5-201ENST00000317378 CHD1O14646 1710 aa36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC5-201ENST00000317378 ARHGEF11O15085 1522 aa36.79■■■■□ 3.48
TRAPPC5-201ENST00000317378 FBLN2P98095 1184 aa36.72■■■■□ 3.47
TRAPPC5-201ENST00000317378 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.64■■■■□ 3.46
TRAPPC5-201ENST00000317378 GRIN2BQ13224 1484 aa36.62■■■■□ 3.45
TRAPPC5-201ENST00000317378 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
TRAPPC5-201ENST00000317378 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.53■■■■□ 3.44
TRAPPC5-201ENST00000317378 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC5-201ENST00000317378 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.52■■■■□ 3.44
TRAPPC5-201ENST00000317378 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.5■■■■□ 3.43
TRAPPC5-201ENST00000317378 SYNJ2O15056 1496 aa36.47■■■■□ 3.43
TRAPPC5-201ENST00000317378 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.45■■■■□ 3.43
TRAPPC5-201ENST00000317378 ARAP1Q96P48 1450 aa36.44■■■■□ 3.42
TRAPPC5-201ENST00000317378 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.41■■■■□ 3.42
TRAPPC5-201ENST00000317378 SYNJ1O43426 1573 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC5-201ENST00000317378 PBRM1Q86U86 1689 aa36.4■■■■□ 3.42
TRAPPC5-201ENST00000317378 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.39■■■■□ 3.42
TRAPPC5-201ENST00000317378 TOP2BQ02880 1626 aa36.34■■■■□ 3.41
TRAPPC5-201ENST00000317378 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.34■■■■□ 3.41
TRAPPC5-201ENST00000317378 GRIN2AQ12879 1464 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 ADAMTS12P58397 1594 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAPPC5-201ENST00000317378 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAPPC5-201ENST00000317378 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC5-201ENST00000317378 NUP160Q12769 1436 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
TRAPPC5-201ENST00000317378 CEP170Q5SW79 1584 aa35.97■■■■□ 3.35
TRAPPC5-201ENST00000317378 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAPPC5-201ENST00000317378 SHROOM2Q13796 1616 aa35.84■■■■□ 3.33
TRAPPC5-201ENST00000317378 JPH4Q96JJ6 628 aa35.68■■■■□ 3.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 IGF1RP08069 1367 aa35.67■■■■□ 3.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIF27Q86VH2 1401 aa35.65■■■■□ 3.3
TRAPPC5-201ENST00000317378 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms