Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXC10Q9NYD6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOXC10Q9NYD6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC10Q9NYD6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HOXC10Q9NYD6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms