Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.12■■■■■ 4.01
HOXC10Q9NYD6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
HOXC10Q9NYD6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
HOXC10Q9NYD6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
HOXC10Q9NYD6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
HOXC10Q9NYD6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
HOXC10Q9NYD6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
HOXC10Q9NYD6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
HOXC10Q9NYD6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
HOXC10Q9NYD6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
HOXC10Q9NYD6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HOXC10Q9NYD6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HOXC10Q9NYD6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
HOXC10Q9NYD6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
HOXC10Q9NYD6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HOXC10Q9NYD6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HOXC10Q9NYD6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HOXC10Q9NYD6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HOXC10Q9NYD6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HOXC10Q9NYD6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HOXC10Q9NYD6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
HOXC10Q9NYD6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HOXC10Q9NYD6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HOXC10Q9NYD6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HOXC10Q9NYD6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
HOXC10Q9NYD6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HOXC10Q9NYD6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HOXC10Q9NYD6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HOXC10Q9NYD6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HOXC10Q9NYD6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HOXC10Q9NYD6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HOXC10Q9NYD6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
HOXC10Q9NYD6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
HOXC10Q9NYD6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
HOXC10Q9NYD6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
HOXC10Q9NYD6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
HOXC10Q9NYD6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
HOXC10Q9NYD6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
HOXC10Q9NYD6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
HOXC10Q9NYD6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HOXC10Q9NYD6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HOXC10Q9NYD6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HOXC10Q9NYD6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
HOXC10Q9NYD6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
HOXC10Q9NYD6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
HOXC10Q9NYD6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
HOXC10Q9NYD6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HOXC10Q9NYD6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
HOXC10Q9NYD6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
HOXC10Q9NYD6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HOXC10Q9NYD6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HOXC10Q9NYD6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HOXC10Q9NYD6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
HOXC10Q9NYD6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HOXC10Q9NYD6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
HOXC10Q9NYD6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
HOXC10Q9NYD6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
HOXC10Q9NYD6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXC10Q9NYD6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXC10Q9NYD6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HOXC10Q9NYD6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
HOXC10Q9NYD6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXC10Q9NYD6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXC10Q9NYD6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
HOXC10Q9NYD6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
HOXC10Q9NYD6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
HOXC10Q9NYD6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
HOXC10Q9NYD6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXC10Q9NYD6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
HOXC10Q9NYD6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
HOXC10Q9NYD6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXC10Q9NYD6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
HOXC10Q9NYD6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HOXC10Q9NYD6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
HOXC10Q9NYD6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HOXC10Q9NYD6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
HOXC10Q9NYD6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HOXC10Q9NYD6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HOXC10Q9NYD6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
HOXC10Q9NYD6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
HOXC10Q9NYD6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
HOXC10Q9NYD6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HOXC10Q9NYD6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HOXC10Q9NYD6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXC10Q9NYD6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HOXC10Q9NYD6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HOXC10Q9NYD6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HOXC10Q9NYD6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
HOXC10Q9NYD6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
HOXC10Q9NYD6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HOXC10Q9NYD6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms