Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBA1CQ9BQE3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TUBA1CQ9BQE3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms