RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.28■■■■■ 5.16
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.8■■■■■ 4.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
ANKRD54-201ENST00000215941 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.32■■■■□ 3.89
ANKRD54-201ENST00000215941 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.06■■■■□ 3.84
ANKRD54-201ENST00000215941 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.98■■■■□ 3.83
ANKRD54-201ENST00000215941 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
ANKRD54-201ENST00000215941 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.2■■■■□ 3.71
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC9O60706 1549 aa38.14■■■■□ 3.7
ANKRD54-201ENST00000215941 HRCP23327 699 aa38■■■■□ 3.67
ANKRD54-201ENST00000215941 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.97■■■■□ 3.67
ANKRD54-201ENST00000215941 NACADO15069 1562 aa37.85■■■■□ 3.65
ANKRD54-201ENST00000215941 SCRIBQ14160 1630 aa37.8■■■■□ 3.64
ANKRD54-201ENST00000215941 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.38■■■■□ 3.58
ANKRD54-201ENST00000215941 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.3■■■■□ 3.56
ANKRD54-201ENST00000215941 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
ANKRD54-201ENST00000215941 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKRD54-201ENST00000215941 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.72■■■■□ 3.47
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
ANKRD54-201ENST00000215941 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
ANKRD54-201ENST00000215941 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.64■■■■□ 3.46
ANKRD54-201ENST00000215941 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.62■■■■□ 3.45
ANKRD54-201ENST00000215941 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
ANKRD54-201ENST00000215941 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
ANKRD54-201ENST00000215941 WIZO95785 1651 aa36.38■■■■□ 3.42
ANKRD54-201ENST00000215941 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.28■■■■□ 3.4
ANKRD54-201ENST00000215941 SMARCA4P51532 1647 aa36.2■■■■□ 3.39
ANKRD54-201ENST00000215941 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.17■■■■□ 3.38
ANKRD54-201ENST00000215941 TRIM41Q8WV44 630 aa36.01■■■■□ 3.36
ANKRD54-201ENST00000215941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
ANKRD54-201ENST00000215941 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ANKRD54-201ENST00000215941 SMARCA2P51531 1590 aa35.66■■■■□ 3.3
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.65■■■■□ 3.3
ANKRD54-201ENST00000215941 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.64■■■■□ 3.3
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
ANKRD54-201ENST00000215941 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.42■■■■□ 3.26
ANKRD54-201ENST00000215941 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
ANKRD54-201ENST00000215941 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC8Q09428 1581 aa35.2■■■■□ 3.23
ANKRD54-201ENST00000215941 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.04■■■■□ 3.2
ANKRD54-201ENST00000215941 NCAPD3P42695 1498 aa34.95■■■■□ 3.19
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGXB3Q12766 1538 aa34.94■■■■□ 3.18
ANKRD54-201ENST00000215941 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-201ENST00000215941 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.91■■■■□ 3.18
ANKRD54-201ENST00000215941 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
ANKRD54-201ENST00000215941 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
ANKRD54-201ENST00000215941 EEA1Q15075 1411 aa34.74■■■■□ 3.15
ANKRD54-201ENST00000215941 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.7■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP162Q5TB80 1403 aa34.69■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 SOGA1O94964 1423 aa34.68■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNJ1O43426 1573 aa34.66■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
ANKRD54-201ENST00000215941 NEUROD1Q13562 356 aa34.59■■■■□ 3.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.53■■■■□ 3.12
ANKRD54-201ENST00000215941 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.47■■■■□ 3.11
ANKRD54-201ENST00000215941 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.46■■■■□ 3.11
ANKRD54-201ENST00000215941 TOP2BQ02880 1626 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD54-201ENST00000215941 CFTRP13569 1480 aa34.4■■■■□ 3.1
ANKRD54-201ENST00000215941 GOLGA3Q08378 1498 aa34.38■■■■□ 3.09
ANKRD54-201ENST00000215941 MYT1Q01538 1121 aa34.35■■■■□ 3.09
ANKRD54-201ENST00000215941 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa34.34■■■■□ 3.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
ANKRD54-201ENST00000215941 PRDM2Q13029 1718 aa34.24■■■■□ 3.07
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF21BO75037 1637 aa34.19■■■■□ 3.06
ANKRD54-201ENST00000215941 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
ANKRD54-201ENST00000215941 CUX1P39880 1505 aa34.18■■■■□ 3.06
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.16■■■■□ 3.06
ANKRD54-201ENST00000215941 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.15■■■■□ 3.06
ANKRD54-201ENST00000215941 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.94■■■■□ 3.02
ANKRD54-201ENST00000215941 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD54-201ENST00000215941 CLIP1P30622 1438 aa33.91■■■■□ 3.02
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF27Q86VH2 1401 aa33.85■■■■□ 3.01
ANKRD54-201ENST00000215941 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.8■■■■□ 3
ANKRD54-201ENST00000215941 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.78■■■■□ 3
ANKRD54-201ENST00000215941 PRXQ9BXM0 1461 aa33.78■■■■□ 3
ANKRD54-201ENST00000215941 CLSPNQ9HAW4 1339 aa33.76■■■■□ 3
ANKRD54-201ENST00000215941 MIER1Q8N108 512 aa33.72■■■□□ 2.99
ANKRD54-201ENST00000215941 NESP48681 1621 aa33.71■■■□□ 2.99
ANKRD54-201ENST00000215941 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.7■■■□□ 2.98
ANKRD54-201ENST00000215941 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
ANKRD54-201ENST00000215941 APLP2Q06481 763 aa33.68■■■□□ 2.98
ANKRD54-201ENST00000215941 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.64■■■□□ 2.98
ANKRD54-201ENST00000215941 CUX2O14529 1486 aa33.64■■■□□ 2.98
ANKRD54-201ENST00000215941 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
ANKRD54-201ENST00000215941 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.6■■■□□ 2.97
ANKRD54-201ENST00000215941 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
ANKRD54-201ENST00000215941 TOPBP1Q92547 1522 aa33.51■■■□□ 2.96
ANKRD54-201ENST00000215941 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.5■■■□□ 2.95
ANKRD54-201ENST00000215941 IGF1RP08069 1367 aa33.49■■■□□ 2.95
ANKRD54-201ENST00000215941 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
ANKRD54-201ENST00000215941 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
ANKRD54-201ENST00000215941 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.39■■■□□ 2.94
ANKRD54-201ENST00000215941 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.38■■■□□ 2.93
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.36■■■□□ 2.93
ANKRD54-201ENST00000215941 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
ANKRD54-201ENST00000215941 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms