Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TUBA1CQ9BQE3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TUBA1CQ9BQE3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TUBA1CQ9BQE3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TUBA1CQ9BQE3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TUBA1CQ9BQE3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TUBA1CQ9BQE3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBA1CQ9BQE3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUBA1CQ9BQE3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TUBA1CQ9BQE3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBA1CQ9BQE3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TUBA1CQ9BQE3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TUBA1CQ9BQE3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TUBA1CQ9BQE3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TUBA1CQ9BQE3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBA1CQ9BQE3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBA1CQ9BQE3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TUBA1CQ9BQE3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBA1CQ9BQE3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBA1CQ9BQE3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBA1CQ9BQE3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBA1CQ9BQE3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUBA1CQ9BQE3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBA1CQ9BQE3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBA1CQ9BQE3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TUBA1CQ9BQE3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TUBA1CQ9BQE3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TUBA1CQ9BQE3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUBA1CQ9BQE3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUBA1CQ9BQE3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBA1CQ9BQE3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBA1CQ9BQE3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUBA1CQ9BQE3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TUBA1CQ9BQE3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBA1CQ9BQE3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBA1CQ9BQE3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBA1CQ9BQE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBA1CQ9BQE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBA1CQ9BQE3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TUBA1CQ9BQE3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TUBA1CQ9BQE3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBA1CQ9BQE3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBA1CQ9BQE3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBA1CQ9BQE3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBA1CQ9BQE3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBA1CQ9BQE3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBA1CQ9BQE3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBA1CQ9BQE3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBA1CQ9BQE3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBA1CQ9BQE3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBA1CQ9BQE3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBA1CQ9BQE3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBA1CQ9BQE3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBA1CQ9BQE3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBA1CQ9BQE3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBA1CQ9BQE3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBA1CQ9BQE3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBA1CQ9BQE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA1CQ9BQE3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBA1CQ9BQE3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TUBA1CQ9BQE3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBA1CQ9BQE3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBA1CQ9BQE3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBA1CQ9BQE3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBA1CQ9BQE3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBA1CQ9BQE3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBA1CQ9BQE3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBA1CQ9BQE3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBA1CQ9BQE3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBA1CQ9BQE3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBA1CQ9BQE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBA1CQ9BQE3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TUBA1CQ9BQE3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBA1CQ9BQE3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TUBA1CQ9BQE3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA1CQ9BQE3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TUBA1CQ9BQE3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TUBA1CQ9BQE3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TUBA1CQ9BQE3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TUBA1CQ9BQE3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TUBA1CQ9BQE3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TUBA1CQ9BQE3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TUBA1CQ9BQE3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TUBA1CQ9BQE3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TUBA1CQ9BQE3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA1CQ9BQE3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms