Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM9SF4Q92544 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TM9SF4Q92544 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms