RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288607.2

PSMG3-202, Transcript of proteasome assembly chaperone 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSMG3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG3-202ENST00000288607 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.59■■■■■ 7.13
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.05■■■■■ 6.08
PSMG3-202ENST00000288607 ABCC9O60706 1549 aa52.3■■■■■ 5.96
PSMG3-202ENST00000288607 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.09■■■■■ 5.61
PSMG3-202ENST00000288607 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50■■■■■ 5.59
PSMG3-202ENST00000288607 NACADO15069 1562 aa49.94■■■■■ 5.59
PSMG3-202ENST00000288607 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.59■■■■■ 5.53
PSMG3-202ENST00000288607 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.5■■■■■ 5.51
PSMG3-202ENST00000288607 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.22■■■■■ 5.47
PSMG3-202ENST00000288607 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.99■■■■■ 5.43
PSMG3-202ENST00000288607 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.84■■■■■ 5.41
PSMG3-202ENST00000288607 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.63■■■■■ 5.37
PSMG3-202ENST00000288607 SCRIBQ14160 1630 aa48.51■■■■■ 5.36
PSMG3-202ENST00000288607 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.24■■■■■ 5.31
PSMG3-202ENST00000288607 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.96■■■■■ 5.27
PSMG3-202ENST00000288607 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
PSMG3-202ENST00000288607 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.25■■■■■ 5.15
PSMG3-202ENST00000288607 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.97■■■■■ 5.11
PSMG3-202ENST00000288607 SMARCA4P51532 1647 aa46.32■■■■■ 5
PSMG3-202ENST00000288607 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
PSMG3-202ENST00000288607 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.13■■■■■ 4.97
PSMG3-202ENST00000288607 NCAPD3P42695 1498 aa46.09■■■■■ 4.97
PSMG3-202ENST00000288607 SMARCA2P51531 1590 aa46.02■■■■■ 4.96
PSMG3-202ENST00000288607 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.97■■■■■ 4.95
PSMG3-202ENST00000288607 HMGXB3Q12766 1538 aa45.86■■■■■ 4.93
PSMG3-202ENST00000288607 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.8■■■■■ 4.92
PSMG3-202ENST00000288607 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.74■■■■■ 4.91
PSMG3-202ENST00000288607 WIZO95785 1651 aa45.47■■■■■ 4.87
PSMG3-202ENST00000288607 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
PSMG3-202ENST00000288607 NESP48681 1621 aa45.18■■■■■ 4.82
PSMG3-202ENST00000288607 ERCC6Q03468 1493 aa45.07■■■■■ 4.81
PSMG3-202ENST00000288607 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.93■■■■■ 4.78
PSMG3-202ENST00000288607 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
PSMG3-202ENST00000288607 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.76■■■■■ 4.76
PSMG3-202ENST00000288607 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.64■■■■■ 4.74
PSMG3-202ENST00000288607 CUX2O14529 1486 aa44.61■■■■■ 4.73
PSMG3-202ENST00000288607 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.61■■■■■ 4.73
PSMG3-202ENST00000288607 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
PSMG3-202ENST00000288607 CFTRP13569 1480 aa44.44■■■■■ 4.7
PSMG3-202ENST00000288607 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.42■■■■■ 4.7
PSMG3-202ENST00000288607 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.29■■■■■ 4.68
PSMG3-202ENST00000288607 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.25■■■■■ 4.67
PSMG3-202ENST00000288607 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.23■■■■■ 4.67
PSMG3-202ENST00000288607 WDR62O43379 1518 aa44.08■■■■■ 4.65
PSMG3-202ENST00000288607 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
PSMG3-202ENST00000288607 PRDM2Q13029 1718 aa44.06■■■■■ 4.64
PSMG3-202ENST00000288607 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.61
PSMG3-202ENST00000288607 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.57■■■■■ 4.57
PSMG3-202ENST00000288607 TOPBP1Q92547 1522 aa43.55■■■■■ 4.56
PSMG3-202ENST00000288607 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.46■■■■■ 4.55
PSMG3-202ENST00000288607 ABCC8Q09428 1581 aa43.44■■■■■ 4.54
PSMG3-202ENST00000288607 IFT140Q96RY7 1462 aa43.31■■■■■ 4.52
PSMG3-202ENST00000288607 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
PSMG3-202ENST00000288607 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
PSMG3-202ENST00000288607 CUX1P39880 1505 aa43.14■■■■■ 4.5
PSMG3-202ENST00000288607 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
PSMG3-202ENST00000288607 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.03■■■■■ 4.48
PSMG3-202ENST00000288607 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.02■■■■■ 4.48
PSMG3-202ENST00000288607 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
PSMG3-202ENST00000288607 SOGA1O94964 1423 aa42.97■■■■■ 4.47
PSMG3-202ENST00000288607 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.91■■■■■ 4.465e-7■■■■□ 25.3
PSMG3-202ENST00000288607 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
PSMG3-202ENST00000288607 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
PSMG3-202ENST00000288607 OSCARQ8IYS5 282 aa42.74■■■■■ 4.43
PSMG3-202ENST00000288607 SYNJ1O43426 1573 aa42.69■■■■■ 4.42
PSMG3-202ENST00000288607 WDR97A6NE52 1622 aa42.66■■■■■ 4.42
PSMG3-202ENST00000288607 TOP2BQ02880 1626 aa42.66■■■■■ 4.42
PSMG3-202ENST00000288607 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.66■■■■■ 4.42
PSMG3-202ENST00000288607 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.56■■■■■ 4.4
PSMG3-202ENST00000288607 CHD1O14646 1710 aa42.51■■■■■ 4.4
PSMG3-202ENST00000288607 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.51■■■■■ 4.4
PSMG3-202ENST00000288607 GRIN2BQ13224 1484 aa42.49■■■■■ 4.39
PSMG3-202ENST00000288607 FBLN2P98095 1184 aa42.48■■■■■ 4.39
PSMG3-202ENST00000288607 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.47■■■■■ 4.39
PSMG3-202ENST00000288607 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.43■■■■■ 4.38
PSMG3-202ENST00000288607 PBRM1Q86U86 1689 aa42.41■■■■■ 4.38
PSMG3-202ENST00000288607 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
PSMG3-202ENST00000288607 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
PSMG3-202ENST00000288607 SYNJ2O15056 1496 aa42.23■■■■■ 4.35
PSMG3-202ENST00000288607 TRIM41Q8WV44 630 aa42.15■■■■■ 4.34
PSMG3-202ENST00000288607 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG3-202ENST00000288607 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG3-202ENST00000288607 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.13■■■■■ 4.34
PSMG3-202ENST00000288607 ARHGEF11O15085 1522 aa42.09■■■■■ 4.33
PSMG3-202ENST00000288607 ADAMTS12P58397 1594 aa42.06■■■■■ 4.32
PSMG3-202ENST00000288607 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.03■■■■■ 4.32
PSMG3-202ENST00000288607 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.02■■■■■ 4.32
PSMG3-202ENST00000288607 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.96■■■■■ 4.31
PSMG3-202ENST00000288607 GRIN2AQ12879 1464 aa41.95■■■■■ 4.31
PSMG3-202ENST00000288607 KIF27Q86VH2 1401 aa41.85■■■■■ 4.29
PSMG3-202ENST00000288607 CEP170Q5SW79 1584 aa41.78■■■■■ 4.28
PSMG3-202ENST00000288607 NUP160Q12769 1436 aa41.76■■■■■ 4.28
PSMG3-202ENST00000288607 ARAP1Q96P48 1450 aa41.74■■■■■ 4.27
PSMG3-202ENST00000288607 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.74■■■■■ 4.27
PSMG3-202ENST00000288607 IGF1RP08069 1367 aa41.72■■■■■ 4.27
PSMG3-202ENST00000288607 CUL7Q14999 1698 aa41.6■■■■■ 4.25
PSMG3-202ENST00000288607 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.49■■■■■ 4.23
PSMG3-202ENST00000288607 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.48■■■■■ 4.23
PSMG3-202ENST00000288607 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.48■■■■■ 4.23
PSMG3-202ENST00000288607 SHROOM2Q13796 1616 aa41.46■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms