Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRG3P56975 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRG3P56975 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NRG3P56975 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRG3P56975 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRG3P56975 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRG3P56975 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRG3P56975 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRG3P56975 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRG3P56975 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NRG3P56975 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRG3P56975 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRG3P56975 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRG3P56975 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRG3P56975 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NRG3P56975 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRG3P56975 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRG3P56975 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NRG3P56975 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NRG3P56975 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NRG3P56975 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG3P56975 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG3P56975 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG3P56975 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG3P56975 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG3P56975 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG3P56975 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG3P56975 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG3P56975 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRG3P56975 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG3P56975 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG3P56975 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG3P56975 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG3P56975 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG3P56975 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG3P56975 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG3P56975 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG3P56975 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG3P56975 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG3P56975 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG3P56975 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG3P56975 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG3P56975 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRG3P56975 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRG3P56975 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRG3P56975 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRG3P56975 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NRG3P56975 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRG3P56975 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NRG3P56975 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRG3P56975 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NRG3P56975 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms