RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614186.5

MDFIC-208, Transcript of MyoD family inhibitor domain containing, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MDFIC, Length 1,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDFIC-208ENST00000614186 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.28■■■■■ 7.4
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MDFIC-208ENST00000614186 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.13■■■■■ 5.78
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MDFIC-208ENST00000614186 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.77■■■■■ 5.56
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MDFIC-208ENST00000614186 SMARCA2P51531 1590 aa47.56■■■■■ 5.2
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MDFIC-208ENST00000614186 WIZO95785 1651 aa46.7■■■■■ 5.07
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MDFIC-208ENST00000614186 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.8■■■■■ 4.92
MDFIC-208ENST00000614186 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.79■■■■■ 4.92
MDFIC-208ENST00000614186 WDR62O43379 1518 aa45.75■■■■■ 4.91
MDFIC-208ENST00000614186 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.61■■■■■ 4.89
MDFIC-208ENST00000614186 PRDM2Q13029 1718 aa45.49■■■■■ 4.87
MDFIC-208ENST00000614186 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.37■■■■■ 4.85
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MDFIC-208ENST00000614186 ABCC8Q09428 1581 aa44.93■■■■■ 4.78
MDFIC-208ENST00000614186 IFT140Q96RY7 1462 aa44.86■■■■■ 4.77
MDFIC-208ENST00000614186 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.84■■■■■ 4.77
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MDFIC-208ENST00000614186 OSCARQ8IYS5 282 aa44.71■■■■■ 4.75
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MDFIC-208ENST00000614186 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
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MDFIC-208ENST00000614186 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.38■■■■■ 4.69
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MDFIC-208ENST00000614186 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.32■■■■■ 4.69
MDFIC-208ENST00000614186 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
MDFIC-208ENST00000614186 CHD1O14646 1710 aa44.15■■■■■ 4.66
MDFIC-208ENST00000614186 WDR97A6NE52 1622 aa44.11■■■■■ 4.65
MDFIC-208ENST00000614186 FBLN2P98095 1184 aa44.08■■■■■ 4.65
MDFIC-208ENST00000614186 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MDFIC-208ENST00000614186 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MDFIC-208ENST00000614186 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.02■■■■■ 4.64
MDFIC-208ENST00000614186 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.96■■■■■ 4.63
MDFIC-208ENST00000614186 GRIN2BQ13224 1484 aa43.92■■■■■ 4.62
MDFIC-208ENST00000614186 ARHGEF11O15085 1522 aa43.92■■■■■ 4.62
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MDFIC-208ENST00000614186 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.83■■■■■ 4.61
MDFIC-208ENST00000614186 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
MDFIC-208ENST00000614186 PBRM1Q86U86 1689 aa43.78■■■■■ 4.6
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MDFIC-208ENST00000614186 TOP2BQ02880 1626 aa43.76■■■■■ 4.6
MDFIC-208ENST00000614186 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.76■■■■■ 4.6
MDFIC-208ENST00000614186 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.73■■■■■ 4.59
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MDFIC-208ENST00000614186 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.63■■■■■ 4.57
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MDFIC-208ENST00000614186 ARAP1Q96P48 1450 aa43.51■■■■■ 4.56
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MDFIC-208ENST00000614186 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.3■■■■■ 4.52
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MDFIC-208ENST00000614186 NUP160Q12769 1436 aa43.18■■■■■ 4.5
MDFIC-208ENST00000614186 CEP170Q5SW79 1584 aa43.16■■■■■ 4.5
MDFIC-208ENST00000614186 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
MDFIC-208ENST00000614186 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.97■■■■■ 4.47
MDFIC-208ENST00000614186 SHROOM2Q13796 1616 aa42.94■■■■■ 4.46
MDFIC-208ENST00000614186 KIF27Q86VH2 1401 aa42.94■■■■■ 4.46
MDFIC-208ENST00000614186 IGF1RP08069 1367 aa42.87■■■■■ 4.45
MDFIC-208ENST00000614186 JPH4Q96JJ6 628 aa42.8■■■■■ 4.44
MDFIC-208ENST00000614186 CUL7Q14999 1698 aa42.76■■■■■ 4.44
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